| Title: |
First DNA sequence reference library for mammals and plants of the Eastern Mediterranean Region. |
| Authors: |
Boukhdoud, Liliane; Saliba, Carole; Parker, Lillian D.; Rotzel McInerney, Nancy; Ishak Mouawad, Ghiwa; Kharrat, Mariane; Kahale, Rhea; Chahine, Tony; Maldonado, Jesús E.; Bou Dagher-Kharrat, Magda |
| Source: |
Genome; 2020, Vol. 64 Issue 1, p39-49, 11p |
| Subject Terms: |
Nucleotide sequence; Genetic barcoding; Animal species; Endangered species; Plant species; Ribosomal RNA |
| Geographic Terms: |
Lebanon |
| Abstract (English): |
The Mediterranean region is identified as one of the world's 36 biodiversity hotspots, with the Earth's most biologically rich yet threatened areas. Lebanon is a hub for Eastern Mediterranean Region (EMR) biodiversity with 9116 characterized plant and animal species (4486 fauna and 4630 flora). Using DNA barcoding as a tool has become crucial in the accurate identification of species in multiple contexts. It can also complement species morphological descriptions, which will add to our understanding of the biodiversity and richness of ecosystems and benefit conservation projects for endangered and endemic species. In this study, we create the first reference library of standard DNA markers for mammals and plants in the EMR, with a focus on endemic and endangered species. Plant leaves were collected from different nature reserves in Mount Lebanon, and mammal samples were obtained from taxidermized museum specimens or road kills. We generated the 12S rRNA sequences of 18 mammal species from 6 orders and 13 different families. We also obtained the trnL and rbcL barcode sequences of 52 plant species from 24 different families. Twenty-five plant species and two mammal species included in this study were sequenced for the first time using these markers. [ABSTRACT FROM AUTHOR] |
| Abstract (French): |
La région méditerranéenne est l'une des 36 zones riches en biodiversité dans le monde ; ces régions de la terre étant parmi les plus riches biologiquement mais en même temps les plus menacées. Le Liban constitue un point chaud pour la biodiversité dans la Méditerranée orientale avec ses 9116 espèces végétales et animales répertoriées, dont la faune compte 4486 espèces et la flore 4630 espèces. Le codage à barres de l'ADN est devenu un outil essentiel pour l'identification juste des espèces dans de nombreux contextes. Il peut aussi s'avérer complémentaire aux descriptions morphologiques des espèces, ce qui contribuera à notre connaissance de la biodiversité et de la richesse de ces écosystèmes tout en étant utile pour des projets de protection des espèces menacées ou indigènes. Dans cette étude, les auteurs ont créé une première banque de référence pour des marqueurs de l'ADN standard chez les espèces de mammifères et de plantes de la Méditerranée orientale, l'emphase étant placée sur les espèces indigènes ou menacées. Des feuilles ont été prélevées dans différentes réserves naturelles de la région du Mont Liban, tandis que des échantillons de mammifères ont été obtenus à partir de spécimens taxidermisés dans des musées ou d'animaux tués sur la route. Les auteurs ont généré des séquences pour l'ARNr 12S chez 18 espèces de mammifères appartenant à 6 ordres et 13 familles différentes. Ils ont également obtenu des séquences pour les codes à barres trnL et rbcL à partir de 52 espèces végétales appartenant à 24 familles. Vingt-cinq espèces végétales et deux espèces de mammifères incluses dans ce travail ont été séquencées pour la première fois à l'aide de ces marqueurs. [Traduit par la Rédaction] [ABSTRACT FROM AUTHOR] |
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