Cost-Effective Method to Perform SARS-CoV-2 Variant Surveillance: Detection of Alpha, Gamma, Lambda, Delta, Epsilon, and Zeta in Argentina.
| Title: | Cost-Effective Method to Perform SARS-CoV-2 Variant Surveillance: Detection of Alpha, Gamma, Lambda, Delta, Epsilon, and Zeta in Argentina. |
|---|---|
| Authors: | Torres C; Facultad de Farmacia y Bioquímica, Instituto de Investigaciones en Bacteriología y Virología Molecular (IBaViM), Universidad de Buenos Aires, Buenos Aires, Argentina.; Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET), Buenos Aires, Argentina.; Mojsiejczuk L; Facultad de Farmacia y Bioquímica, Instituto de Investigaciones en Bacteriología y Virología Molecular (IBaViM), Universidad de Buenos Aires, Buenos Aires, Argentina.; Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET), Buenos Aires, Argentina.; Acuña D; Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET), Buenos Aires, Argentina.; Laboratorio de Virología, Hospital de Niños Dr. Ricardo Gutiérrez, Buenos Aires, Argentina.; Alexay S; Laboratorio de Virología, Hospital de Niños Dr. Ricardo Gutiérrez, Buenos Aires, Argentina.; Amadio A; Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET), Buenos Aires, Argentina.; Instituto de Investigación de la Cadena Láctea (IDICAL) INTA-CONICET, Rafaela, Argentina.; Aulicino P; Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET), Buenos Aires, Argentina.; Laboratorio de Biología Celular y Retrovirus, Hospital de Pediatría 'Prof. Juan P. Garrahan', Buenos Aires, Argentina.; Debat H; Instituto de Patología Vegetal - Centro de Investigaciones Agropecuarias - Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (IPAVE-CIAP-INTA), Córdoba, Argentina.; Fay F; CIBIC Laboratorio, Rosario, Argentina.; Fernández F; Instituto de Patología Vegetal - Centro de Investigaciones Agropecuarias - Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (IPAVE-CIAP-INTA), Córdoba, Argentina.; Giri AA; Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET), Buenos Aires, Argentina.; Grupo Virología Humana, Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario CONICET, Rosario, Argentina.; Goya S; Laboratorio de Virología, Hospital de Niños Dr. Ricardo Gutiérrez, Buenos Aires, Argentina.; König G; Instituto de Biotecnología/Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular INTA-CONICET, Hurlingham, Argentina.; Lucero H; Instituto de Medicina Regional, Universidad Nacional del Nordeste, Resistencia, Argentina.; Nabaes Jodar M; Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET), Buenos Aires, Argentina.; Laboratorio de Virología, Hospital de Niños Dr. Ricardo Gutiérrez, Buenos Aires, Argentina.; Pianciola L; Laboratorio Central Ciudad de Neuquén, Ministerio de Salud, Neuquén, Argentina.; Sfalcin JA; CIBIC Laboratorio, Rosario, Argentina.; Acevedo RM; Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET), Buenos Aires, Argentina.; Instituto de Botánica del Nordeste, Universidad Nacional del Nordeste-CONICET, Resistencia, Argentina.; Bengoa Luoni S; Instituto de Biotecnología/Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular INTA-CONICET, Hurlingham, Argentina.; Bolatti EM; Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET), Buenos Aires, Argentina.; Grupo Virología Humana, Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario CONICET, Rosario, Argentina.; Brusés B; Instituto de Medicina Regional, Universidad Nacional del Nordeste, Resistencia, Argentina.; Cacciabue M; Instituto de Biotecnología/Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular INTA-CONICET, Hurlingham, Argentina.; Casal PE; Grupo Virología Humana, Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario CONICET, Rosario, Argentina.; Cerri A; Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET), Buenos Aires, Argentina.; Grupo Virología Humana, Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario CONICET, Rosario, Argentina.; Chouhy D; Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET), Buenos Aires, Argentina.; Grupo Virología Humana, Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario CONICET, Rosario, Argentina.; Dus Santos MJ; Instituto de Virología e Innovaciones Tecnológicas INTA-CONICET, Hurlingham, Argentina.; Laboratorio de Diagnóstico-UNIDAD COVID- Universidad Nacional de Hurlingham, Hurlingham, Argentina.; Eberhardt MF; Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET), Buenos Aires, Argentina.; Instituto de Investigación de la Cadena Láctea (IDICAL) INTA-CONICET, Rafaela, Argentina.; Fernandez A; Laboratorio Central Ciudad de Neuquén, Ministerio de Salud, Neuquén, Argentina.; Fernández PDC; Instituto de Biotecnología/Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular INTA-CONICET, Hurlingham, Argentina.; Fernández Do Porto D; Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET), Buenos Aires, Argentina.; Instituto de Cálculo, Facultad de Ciencias Exactas y Naturales, Universidad de Buenos Aires, Buenos Aires, Argentina.; Formichelli L; Instituto de Medicina Regional, Universidad Nacional del Nordeste, Resistencia, Argentina.; Gismondi MI; CIBIC Laboratorio, Rosario, Argentina.; Departamento de Ciencias Básicas, Universidad Nacional de Luján, Luján, Argentina.; Irazoqui M; Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET), Buenos Aires, Argentina.; Instituto de Investigación de la Cadena Láctea (IDICAL) INTA-CONICET, Rafaela, Argentina.; Campos ML; Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET), Buenos Aires, Argentina.; Instituto de Medicina Regional, Universidad Nacional del Nordeste, Resistencia, Argentina.; Lusso S; Laboratorio de Virología, Hospital de Niños Dr. Ricardo Gutiérrez, Buenos Aires, Argentina.; Marquez N; Instituto de Patología Vegetal - Centro de Investigaciones Agropecuarias - Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (IPAVE-CIAP-INTA), Córdoba, Argentina.; Muñoz M; Unidad de Genómica del Instituto de Biotecnología/Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular, INTA-CONICET, Hurlingham, Argentina.; Mussin J; Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET), Buenos Aires, Argentina.; Instituto de Medicina Regional, Universidad Nacional del Nordeste, Resistencia, Argentina.; Natale M; Laboratorio de Virología, Hospital de Niños Dr. Ricardo Gutiérrez, Buenos Aires, Argentina.; Oria G; Instituto de Medicina Regional, Universidad Nacional del Nordeste, Resistencia, Argentina.; Pisano MB; Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET), Buenos Aires, Argentina.; Instituto de Virología 'Dr. J. M. Vanella', Facultad de Ciencias Médicas, Universidad Nacional de Córdoba, Córdoba, Argentina.; Posner V; Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET), Buenos Aires, Argentina.; Laboratorio Mixto de Biotecnología Acuática, Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas, Universidad Nacional de Rosario, Rosario, Argentina.; Puebla A; Unidad de Genómica del Instituto de Biotecnología/Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular, INTA-CONICET, Hurlingham, Argentina.; Re V; Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET), Buenos Aires, Argentina.; Instituto de Virología 'Dr. J. M. Vanella', Facultad de Ciencias Médicas, Universidad Nacional de Córdoba, Córdoba, Argentina.; Sosa E; Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales (IQUIBICEN), CONICET, Ciudad Universitaria, Buenos Aires, Argentina.; Villanova GV; Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET), Buenos Aires, Argentina.; Laboratorio Mixto de Biotecnología Acuática, Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas, Universidad Nacional de Rosario, Rosario, Argentina.; Zaiat J; Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales (IQUIBICEN), CONICET, Ciudad Universitaria, Buenos Aires, Argentina.; Zunino S; Laboratorio Central Ciudad de Neuquén, Ministerio de Salud, Neuquén, Argentina.; Laboratorio de Virología Molecular, Hospital Blas L. Dubarry, Mercedes, Argentina.; Acevedo ME; Laboratorio de Virología, Hospital de Niños Dr. Ricardo Gutiérrez, Buenos Aires, Argentina.; Acosta J; Centro de Tecnología en Salud Pública, Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas, Universidad Nacional de Rosario, Rosario, Argentina.; Alvarez Lopez C; Laboratorio de Virología, Hospital de Niños Dr. Ricardo Gutiérrez, Buenos Aires, Argentina.; Álvarez ML; Laboratorio del Hospital Zonal Dr. Ramón Carrillo, San Carlos de Bariloche, Argentina.; Angeleri P; Comité Operativo de Emergencia COVID, Ministerio de Salud de la Ciudad Autónoma de Buenos Aires, Buenos Aires, Argentina.; Angelletti A; Laboratorio de Salud Pública, Facultad de Ciencias Exactas, Universidad Nacional de La Plata, La Plata, Argentina.; Laboratorio de Virología, HIEAyC 'San Juan de Dios', La Plata, Argentina.; Arca M; Laboratorio de Virología del Hospital JJ Urquiza, Concepción del Uruguay, Argentina.; Ayala NA; Laboratorio Central de Salud Pública del Chaco, Resistencia, Argentina.; Barbas G; Secretaria de Prevención y Promoción, Ministerio de Salud de la Provincia de Córdoba, Córdoba, Argentina.; Bertone A; Laboratorio de la Dirección de Epidemiología, Santa Rosa, Argentina.; Bonnet A; Laboratorio de Virología del Hospital JJ Urquiza, Concepción del Uruguay, Argentina.; Bourlot I; Laboratorio de Biología Molecular del Hospital Centenario, Gualeguaychú, Argentina.; Cabassi V; Laboratorio de Salud Pública, Facultad de Ciencias Exactas, Universidad Nacional de La Plata, La Plata, Argentina.; Castello A; Unidad de Emergencia COVID-19, Plataforma de Servicios Biotecnológicos, Universidad Nacional de Quilmes, Bernal, Argentina.; Castro G; Laboratorio Central de la Provincia de Córdoba, Ministerio de Salud la Provincia de Córdoba, Córdoba, Argentina.; Cavatorta AL; Centro de Tecnología en Salud Pública, Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas, Universidad Nacional de Rosario, Rosario, Argentina.; Ceriani C; Laboratorio de Virología, Facultad de Veterinaria, Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires, Buenos Aires, Argentina.; Cimmino C; Instituto Nacional de Epidemiología 'Dr. Jara', Mar del Plata, Argentina.; Cipelli J; Laboratorio de Virología, Hospital de Niños Dr. Ricardo Gutiérrez, Buenos Aires, Argentina.; Colmeiro M; Laboratorio de Virología, HIEAyC 'San Juan de Dios', La Plata, Argentina.; Cordero A; Laboratorio de Salud Pública, Facultad de Ciencias Exactas, Universidad Nacional de La Plata, La Plata, Argentina.; Cristina C; Centro de Investigaciones Básicas y Aplicadas, Universidad Nacional del Noroeste de la Provincia de Buenos Aires, Junín, Argentina.; Di Bella S; Laboratorio de Virología, HIEAyC 'San Juan de Dios', La Plata, Argentina.; Dolcini G; Laboratorio de Virología, Facultad de Veterinaria, Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires, Buenos Aires, Argentina.; Ercole R; Laboratorio de Virología, HIEAyC 'San Juan de Dios', La Plata, Argentina.; Espasandin Y; Laboratorio del Hospital Zonal Dr. Ramón Carrillo, San Carlos de Bariloche, Argentina.; Espul C; Dirección de Epidemiología y Red de Laboratorios del Ministerio de Salud de la Provincia de Mendoza, Mendoza, Argentina.; Falaschi A; Dirección de Epidemiología y Red de Laboratorios del Ministerio de Salud de la Provincia de Mendoza, Mendoza, Argentina.; Fernandez Moll F; Centro de Investigaciones Básicas y Aplicadas, Universidad Nacional del Noroeste de la Provincia de Buenos Aires, Junín, Argentina.; Foussal MD; Servicio de Inmunología, Hospital Dr. Julio C Perrando, Resistencia, Argentina.; Gatelli A; Laboratorio de Virología, HIEAyC 'San Juan de Dios', La Plata, Argentina.; Goñi S; Unidad de Emergencia COVID-19, Plataforma de Servicios Biotecnológicos, Universidad Nacional de Quilmes, Bernal, Argentina.; Jofré ME; Laboratorio de Biología Molecular Bolívar, LABBO, Bolívar, Argentina.; Jaramillo J; Laboratorio de Virología Molecular, Hospital Blas L. Dubarry, Mercedes, Argentina.; Labarta N; Laboratorio de Virología, Hospital de Niños Dr. Ricardo Gutiérrez, Buenos Aires, Argentina.; Lacaze MA; Programa Laboratorio de Salud Pública 'Dr Dalmiro Pérez Laborda', Ministerio de Salud de la Provincia de San Luis, San Luis, Argentina.; Larreche R; Laboratorio de Biología Molecular Bolívar, LABBO, Bolívar, Argentina.; Leiva V; Laboratorio de Salud Pública, Godoy Cruz, Argentina.; Levin G; Laboratorio de Biología Molecular del Hospital Centenario, Gualeguaychú, Argentina.; Luczak E; Laboratorio del Hospital Interzonal General de Agudos 'Evita', Lanús, Argentina.; Mandile M; Unidad de Emergencia COVID-19, Plataforma de Servicios Biotecnológicos, Universidad Nacional de Quilmes, Bernal, Argentina.; Marino G; Laboratorio Pediátrico Avelino Castelán, Resistencia, Argentina.; Massone C; Laboratorio de Virología Molecular, Hospital Blas L. Dubarry, Mercedes, Argentina.; Mazzeo M; Laboratorio Central Ciudad de Neuquén, Ministerio de Salud, Neuquén, Argentina.; Medina C; Laboratorio de Virología, Hospital de Niños Dr. Ricardo Gutiérrez, Buenos Aires, Argentina.; Monaco B; Laboratorio de Virología Molecular, Hospital Blas L. Dubarry, Mercedes, Argentina.; Montoto L; Laboratorio de Biología Molecular Hospital Pedro de Elizalde, Buenos Aires, Argentina.; Mugna V; Laboratorio Central, Santa Fe, Argentina.; Musto A; Laboratorio de Salud Pública, Godoy Cruz, Argentina.; Nadalich V; Laboratorio de Salud Pública, Facultad de Ciencias Exactas, Universidad Nacional de La Plata, La Plata, Argentina.; Nieto MV; Laboratorio de Virología, Facultad de Veterinaria, Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires, Buenos Aires, Argentina.; Ojeda G; Laboratorio Central, Santa Fe, Argentina.; Piedrabuena AC; Servicio de Microbiología, Hospital 4 de Junio, Presidencia Roque Saenz Peña, Argentina.; Pintos C; Laboratorio Central Ciudad de Neuquén, Ministerio de Salud, Neuquén, Argentina.; Pozzati M; Laboratorio de Biología Molecular, Hospital Cosme Argerich, Buenos Aires, Argentina.; Rahhal M; Laboratorio de Hospital El Cruce Dr. Néstor C. Kirchner, Florencio Varela, Argentina.; Rechimont C; Laboratorio de la Dirección de Epidemiología, Santa Rosa, Argentina.; Remes Lenicov F; Instituto de Investigaciones Biomédicas en Retrovirus y Sida, CONICET-UBA, Buenos Aires, Argentina.; Rompato G; Laboratorio Central, Santa Fe, Argentina.; Seery V; Instituto de Investigaciones Biomédicas en Retrovirus y Sida, CONICET-UBA, Buenos Aires, Argentina.; Siri L; Laboratorio de Biología Molecular del Hospital Centenario, Gualeguaychú, Argentina.; Spina J; Laboratorio de Biología Molecular, Hospital Dr. Héctor Cura, Olavarría, Argentina.; Streitenberger C; Laboratorio de Virología, Hospital de Niños Dr. Ricardo Gutiérrez, Buenos Aires, Argentina.; Suárez A; Departamento de Biología y Genética Molecular; IACA Laboratorios, Bahía Blanca, Argentina.; Suárez J; Centro de Investigaciones Básicas y Aplicadas, Universidad Nacional del Noroeste de la Provincia de Buenos Aires, Junín, Argentina.; Sujansky P; Comité Operativo de Emergencia COVID, Ministerio de Salud de la Ciudad Autónoma de Buenos Aires, Buenos Aires, Argentina.; Talia JM; Programa Laboratorio de Salud Pública 'Dr Dalmiro Pérez Laborda', Ministerio de Salud de la Provincia de San Luis, San Luis, Argentina.; Theaux C; Laboratorio de Biología Molecular del Hospital General de Agudos Dr. Carlos G. Durand, Buenos Aires, Argentina.; Thomas G; Laboratorio de Virología, Hospital de Niños Dr. Ricardo Gutiérrez, Buenos Aires, Argentina.; Ticeira M; Laboratorio de Biología Molecular Bolívar, LABBO, Bolívar, Argentina.; Tittarelli E; Departamento de Biología y Genética Molecular; IACA Laboratorios, Bahía Blanca, Argentina.; Toro R; Laboratorio de Salud Pública, Facultad de Ciencias Exactas, Universidad Nacional de La Plata, La Plata, Argentina.; Uez O; Instituto Nacional de Epidemiología 'Dr. Jara', Mar del Plata, Argentina.; Zaffanella MB; Laboratorio de Biología Molecular, Hospital Dr. Héctor Cura, Olavarría, Argentina.; Ziehm C; Laboratorio Central Ciudad de Neuquén, Ministerio de Salud, Neuquén, Argentina.; Zubieta M; Laboratorio de Hospital El Cruce Dr. Néstor C. Kirchner, Florencio Varela, Argentina.; Mistchenko AS; Laboratorio de Virología, Hospital de Niños Dr. Ricardo Gutiérrez, Buenos Aires, Argentina.; Comisión de Investigaciones Científicas de la Provincia de Buenos Aires, La Plata, Argentina.; Valinotto L; Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET), Buenos Aires, Argentina.; Laboratorio de Virología, Hospital de Niños Dr. Ricardo Gutiérrez, Buenos Aires, Argentina.; Viegas M; Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET), Buenos Aires, Argentina.; Laboratorio de Virología, Hospital de Niños Dr. Ricardo Gutiérrez, Buenos Aires, Argentina. |
| Source: | Frontiers in medicine [Front Med (Lausanne)] 2021 Dec 10; Vol. 8, pp. 755463. Date of Electronic Publication: 2021 Dec 10 (Print Publication: 2021). |
| Publication Type: | Journal Article |
| Language: | English |
| Journal Info: | Publisher: Frontiers Media S.A Country of Publication: Switzerland NLM ID: 101648047 Publication Model: eCollection Cited Medium: Print ISSN: 2296-858X (Print) Linking ISSN: 2296858X NLM ISO Abbreviation: Front Med (Lausanne) Subsets: PubMed not MEDLINE |
| Imprint Name(s): | Original Publication: Lausanne, Switzerland : Frontiers Media S.A., [2014]- |
| Abstract: | SARS-CoV-2 variants with concerning characteristics have emerged since the end of 2020. Surveillance of SARS-CoV-2 variants was performed on a total of 4,851 samples from the capital city and 10 provinces of Argentina, during 51 epidemiological weeks (EWs) that covered the end of the first wave and the ongoing second wave of the COVID-19 pandemic in the country (EW 44/2020 to EW 41/2021). The surveillance strategy was mainly based on Sanger sequencing of a Spike coding region that allows the identification of signature mutations associated with variants. In addition, whole-genome sequences were obtained from 637 samples. The main variants found were Gamma and Lambda, and to a lesser extent, Alpha, Zeta, and Epsilon, and more recently, Delta. Whereas, Gamma dominated in different regions of the country, both Gamma and Lambda prevailed in the most populated area, the metropolitan region of Buenos Aires. The lineages that circulated on the first wave were replaced by emergent variants in a term of a few weeks. At the end of the ongoing second wave, Delta began to be detected, replacing Gamma and Lambda. This scenario is consistent with the Latin American variant landscape, so far characterized by a concurrent increase in Delta circulation and a stabilization in the number of cases. The cost-effective surveillance protocol presented here allowed for a rapid response in a resource-limited setting, added information on the expansion of Lambda in South America, and contributed to the implementation of public health measures to control the disease spread in Argentina.; (Copyright © 2021 Torres, Mojsiejczuk, Acuña, Alexay, Amadio, Aulicino, Debat, Fay, Fernández, Giri, Goya, König, Lucero, Nabaes Jodar, Pianciola, Sfalcin, Acevedo, Bengoa Luoni, Bolatti, Brusés, Cacciabue, Casal, Cerri, Chouhy, Dus Santos, Eberhardt, Fernandez, Fernández, Fernández Do Porto, Formichelli, Gismondi, Irazoqui, Campos, Lusso, Marquez, Muñoz, Mussin, Natale, Oria, Pisano, Posner, Puebla, Re, Sosa, Villanova, Zaiat, Zunino, Acevedo, Acosta, Alvarez Lopez, Álvarez, Angeleri, Angelletti, Arca, Ayala, Barbas, Bertone, Bonnet, Bourlot, Cabassi, Castello, Castro, Cavatorta, Ceriani, Cimmino, Cipelli, Colmeiro, Cordero, Cristina, Di Bella, Dolcini, Ercole, Espasandin, Espul, Falaschi, Fernandez Moll, Foussal, Gatelli, Goñi, Jofré, Jaramillo, Labarta, Lacaze, Larreche, Leiva, Levin, Luczak, Mandile, Marino, Massone, Mazzeo, Medina, Monaco, Montoto, Mugna, Musto, Nadalich, Nieto, Ojeda, Piedrabuena, Pintos, Pozzati, Rahhal, Rechimont, Remes Lenicov, Rompato, Seery, Siri, Spina, Streitenberger, Suárez, Suárez, Sujansky, Talia, Theaux, Thomas, Ticeira, Tittarelli, Toro, Uez, Zaffanella, Ziehm, Zubieta, Mistchenko, Valinotto and Viegas.) |
| Competing Interests: | The authors declare that the research was conducted in the absence of any commercial or financial relationships that could be construed as a potential conflict of interest. |
| References: | Lancet. 2021 Jun 26;397(10293):2461-2462. (PMID: 34139198); Elife. 2020 Oct 28;9:. (PMID: 33112236); Cell. 2021 Apr 29;184(9):2372-2383.e9. (PMID: 33743213); Nat Rev Microbiol. 2021 Jul;19(7):409-424. (PMID: 34075212); Mol Biol Evol. 2013 Apr;30(4):772-80. (PMID: 23329690); Microbiol Spectr. 2021 Oct 31;9(2):e0078921. (PMID: 34704780); medRxiv. 2021 Mar 09;:. (PMID: 33758899); Nat Rev Genet. 2021 Dec;22(12):757-773. (PMID: 34535792); Cell Host Microbe. 2021 Jan 13;29(1):44-57.e9. (PMID: 33259788); Emerg Infect Dis. 2020 Oct;26(10):2401-2405. (PMID: 32610037); Cell Rep. 2022 Jan 11;38(2):110218. (PMID: 34968415); Syst Biol. 2010 May;59(3):307-21. (PMID: 20525638); Science. 2020 Aug 21;369(6506):1014-1018. (PMID: 32540904); Front Med (Lausanne). 2021 Dec 10;8:755463. (PMID: 34957143); Cell Host Microbe. 2021 Mar 10;29(3):477-488.e4. (PMID: 33535027); Cell Host Microbe. 2021 May 12;29(5):747-751.e4. (PMID: 33887205); Science. 2021 May 21;372(6544):815-821. (PMID: 33853970); Cell. 2020 Sep 3;182(5):1295-1310.e20. (PMID: 32841599); Cell Rep. 2022 May 17;39(7):110829. (PMID: 35550680); Mol Biol Evol. 2020 May 1;37(5):1530-1534. (PMID: 32011700); mBio. 2022 Jan 25;13(1):e0344221. (PMID: 35073758); Mol Biol Evol. 2018 Feb 1;35(2):518-522. (PMID: 29077904); Euro Surveill. 2021 Apr;26(16):. (PMID: 33890566) |
| Contributed Indexing: | Keywords: Delta; Gamma; Lambda; SARS-CoV-2; South America; spike sequences; surveillance; variants |
| Entry Date(s): | Date Created: 20211227 Latest Revision: 20231103 |
| Update Code: | 20260130 |
| PubMed Central ID: | PMC8703000 |
| DOI: | 10.3389/fmed.2021.755463 |
| PMID: | 34957143 |
| Database: | MEDLINE |
Journal Article