| Title: |
The trans-ancestral genomic architecture of glycemic traits |
| Authors: |
Chen, J. (Ji); Spracklen, C. N. (Cassandra N.); Marenne, G. (Gaelle); Varshney, A. (Arushi); Corbin, L. J. (Laura J.); Luan, J. (Jian'an); Willems, S. M. (Sara M.); Wu, Y. (Ying); Zhang, X. (Xiaoshuai); Horikoshi, M. (Momoko); Boutin, T. S. (Thibaud S.); Magi, R. (Reedik); Waage, J. (Johannes); Li-Gao, R. (Ruifang); Chan, K. H. (Kei Hang Katie); Yao, J. (Jie); Anasanti, M. D. (Mila D.); Chu, A. Y. (Audrey Y.); Claringbould, A. (Annique); Heikkinen, J. (Jani); Hong, J. (Jaeyoung); Hottenga, J.-J. (Jouke-Jan); Huo, S. (Shaofeng); Kaakinen, M. A. (Marika A.); Louie, T. (Tin); Maerz, W. (Winfried); Moreno-Macias, H. (Hortensia); Ndungu, A. (Anne); Nelson, S. C. (Sarah C.); Nolte, I. M. (Ilja M.); North, K. E. (Kari E.); Raulerson, C. K. (Chelsea K.); Ray, D. (Debashree); Rohde, R. (Rebecca); Rybin, D. (Denis); Schurmann, C. (Claudia); Sim, X. (Xueling); Southam, L. (Lorraine); Stewart, I. D. (Isobel D.); Wang, C. A. (Carol A.); Wang, Y. (Yujie); Wu, P. (Peitao); Zhang, W. (Weihua); Ahluwalia, T. S. (Tarunveer S.); Appel, E. V. (Emil V. R.); Bielak, L. F. (Lawrence F.); Brody, J. A. (Jennifer A.); Burtt, N. P. (Noel P.); Cabrera, C. P. (Claudia P.); Cade, B. E. (Brian E.); Chai, J. F. (Jin Fang); Chai, X. (Xiaoran); Chang, L.-C. (Li-Ching); Chen, C.-H. (Chien-Hsiun); Chen, B. H. (Brian H.); Chitrala, K. N. (Kumaraswamy Naidu); Chiu, Y.-F. (Yen-Feng); de Haan, H. G. (Hugoline G.); Delgado, G. E. (Graciela E.); Demirkan, A. (Ayse); Duan, Q. (Qing); Engmann, J. (Jorgen); Fatumo, S. A. (Segun A.); Gayan, J. (Javier); Giulianini, F. (Franco); Gong, J. H. (Jung Ho); Gustafsson, S. (Stefan); Hai, Y. (Yang); Hartwig, F. P. (Fernando P.); He, J. (Jing); Heianza, Y. (Yoriko); Huang, T. (Tao); Huerta-Chagoya, A. (Alicia); Hwang, M. Y. (Mi Yeong); Jensen, R. A. (Richard A.); Kawaguchi, T. (Takahisa); Kentistou, K. A. (Katherine A.); Kim, Y. J. (Young Jin); Kleber, M. E. (Marcus E.); Kooner, I. K. (Ishminder K.); Lai, S. (Shuiqing); Lange, L. A. (Leslie A.); Langefeld, C. D. (Carl D.); Lauzon, M. (Marie); Li, M. (Man); Ligthart, S. (Symen); Liu, J. (Jun); Loh, M. (Marie); Long, J. (Jirong); Lyssenko, V. (Valeriya); Mangino, M. (Massimo); Marzi, C. (Carola); Montasser, M. E. (May E.); Nag, A. (Abhishek); Nakatochi, M. (Masahiro); Noce, D. (Damia); Noordam, R. (Raymond); Pistis, G. (Giorgio); Preuss, M. (Michael); Raffield, L. (Laura); Rasmussen-Torvik, L. J. (Laura J.); Rich, S. S. (Stephen S.); Robertson, N. R. (Neil R.); Rueedi, R. (Rico); Ryan, K. (Kathleen); Sanna, S. (Serena); Saxena, R. (Richa); Schraut, K. E. (Katharina E.); Sennblad, B. (Bengt); Setoh, K. (Kazuya); Smith, A. V. (Albert V.); Sparso, T. (Thomas); Strawbridge, R. J. (Rona J.); Takeuchi, F. (Fumihiko); Tan, J. (Jingyi); Trompet, S. (Stella); van den Akker, E. (Erik); van der Most, P. J. (Peter J.); Verweij, N. (Niek); Vogel, M. (Mandy); Wang, H. (Heming); Wang, C. (Chaolong); Wang, N. (Nan); Warren, H. R. (Helen R.); Wen, W. (Wanqing); Wilsgaard, T. (Tom); Wong, A. (Andrew); Wood, A. R. (Andrew R.); Xie, T. (Tian); Zafarmand, M. H. (Mohammad Hadi); Zhao, J.-H. (Jing-Hua); Zhao, W. (Wei); Amin, N. (Najaf); Arzumanyan, Z. (Zorayr); Astrup, A. (Arne); Bakker, S. J. (Stephan J. L.); Baldassarre, D. (Damiano); Beekman, M. (Marian); Bergman, R. N. (Richard N.); Bertoni, A. (Alain); Blueher, M. (Matthias); Bonnycastle, L. L. (Lori L.); Bornstein, S. R. (Stefan R.); Bowden, D. W. (Donald W.); Cai, Q. (Qiuyin); Campbell, A. (Archie); Campbell, H. (Harry); Chang, Y. C. (Yi Cheng); de Geus, E. J. (Eco J. C.); Dehghan, A. (Abbas); Du, S. (Shufa); Eiriksdottir, G. (Gudny); Farmaki, A. E. (Aliki Eleni); Franberg, M. (Mattias); Fuchsberger, C. (Christian); Gao, Y. (Yutang); Gjesing, A. P. (Anette P.); Goel, A. (Anuj); Han, S. (Sohee); Hartman, C. A. (Catharina A.); Herder, C. (Christian); Hicks, A. A. (Andrew A.); Hsieh, C.-H. (Chang-Hsun); Hsueh, W. A. (Willa A.); Ichihara, S. (Sahoko); Igase, M. (Michiya); Ikram, M. A. (M. Arfan); Johnson, W. C. (W. Craig); Jorgensen, M. E. (Marit E.); Joshi, P. K. (Peter K.); Kalyani, R. R. (Rita R.); Kandeel, F. R. (Fouad R.); Katsuya, T. (Tomohiro); Khor, C. C. (Chiea Chuen); Kiess, W. (Wieland); Kolcic, I. (Ivana); Kuulasmaa, T. (Teemu); Kuusisto, J. (Johanna); Lall, K. (Kristi); Lam, K. (Kelvin); Lawlor, D. A. (Deborah A.); Lee, N. R. (Nanette R.); Lemaitre, R. N. (Rozenn N.); Li, H. (Honglan); Lin, S.-Y. (Shih-Yi); Lindstrom, J. (Jaana); Linneberg, A. (Allan); Liu, J. (Jianjun); Lorenzo, C. (Carlos); Matsubara, T. (Tatsuaki); Matsuda, F. (Fumihiko); Mingrone, G. (Geltrude); Mooijaart, S. (Simon); Moon, S. (Sanghoon); Nabika, T. (Toru); Nadkarni, G. N. (Girish N.); Nadler, J. L. (Jerry L.); Nelis, M. (Mari); Neville, M. J. (Matt J.); Norris, J. M. (Jill M.); Ohyagi, Y. (Yasumasa); Peters, A. (Annette); Peyser, P. A. (Patricia A.); Polasek, O. (Ozren); Qi, Q. (Qibin); Raven, D. (Dennis); Reilly, D. F. (Dermot F.); Reiner, A. (Alex); Rivideneira, F. (Fernando); Roll, K. (Kathryn); Rudan, I. (Igor); Sabanayagam, C. (Charumathi); Sandow, K. (Kevin); Sattar, N. (Naveed); Schuermann, A. (Annette); Shi, J. (Jinxiu); Stringham, H. M. (Heather M.); Taylor, K. D. (Kent D.); Teslovich, T. M. (Tanya M.); Thuesen, B. (Betina); Timmers, P. R. (Paul R. H. J.); Tremoli, E. (Elena); Tsai, M. Y. (Michael Y.); Uitterlinden, A. (Andre); van Dam, R. M. (Rob M.); van Heemst, D. (Diana); van Hylckama Vlieg, A. (Astrid); van Vliet-Ostaptchouk, J. V. (Jana V.); Vangipurapu, J. (Jagadish); Vestergaard, H. (Henrik); Wang, T. (Tao); Willems van Dijk, K. (Ko); Zemunik, T. (Tatijana); Abecasis, G. R. (Goncalo R.); Adair, L. S. (Linda S.); Aguilar-Salinas, C. A. (Carlos Alberto); Alarcon-Riquelme, M. E. (Marta E.); An, P. (Ping); Aviles-Santa, L. (Larissa); Becker, D. M. (Diane M.); Beilin, L. J. (Lawrence J.); Bergmann, S. (Sven); Bisgaard, H. (Hans); Black, C. (Corri); Boehnke, M. (Michael); Boerwinkle, E. (Eric); Boehm, B. O. (Bernhard O.); Bonnelykke, K. (Klaus); Boomsma, D. I. (D. I.); Bottinger, E. P. (Erwin P.); Buchanan, T. A. (Thomas A.); Canouil, M. (Mickael); Caulfield, M. J. (Mark J.); Chambers, J. C. (John C.); Chasman, D. I. (Daniel I.); Chen, Y. I. (Yii-Der Ida); Cheng, C.-Y. (Ching-Yu); Collins, F. S. (Francis S.); Correa, A. (Adolfo); Cucca, F. (Francesco); de Silva, H. J. (H. Janaka); Dedoussis, G. (George); Elmstahl, S. (Solve); Evans, M. K. (Michele K.); Ferrannini, E. (Ele); Ferrucci, L. (Luigi); Florez, J. C. (Jose C.); Franks, P. W. (Paul W.); Frayling, T. M. (Timothy M.); Froguel, P. (Philippe); Gigante, B. (Bruna); Goodarzi, M. O. (Mark O.); Gordon-Larsen, P. (Penny); Grallert, H. (Harald); Grarup, N. (Niels); Grimsgaard, S. (Sameline); Groop, L. (Leif); Gudnason, V. (Vilmundur); Guo, X. (Xiuqing); Hamsten, A. (Anders); Hansen, T. (Torben); Hayward, C. (Caroline); Heckbert, S. R. (Susan R.); Horta, B. L. (Bernardo L.); Huang, W. (Wei); Ingelsson, E. (Erik); James, P. S. (Pankow S.); Järvelin, M.-R. (Marjo-Ritta); Jonas, J. B. (Jost B.); Jukema, J. W. (J. Wouter); Kaleebu, P. (Pontiano); Kaplan, R. (Robert); Kardia, S. L. (Sharon L. R.); Kato, N. (Norihiro); Keinanen-Kiukaanniemi, S. M. (Sirkka M.); Kim, B.-J. (Bong-Jo); Kivimaki, M. (Mika); Koistinen, H. A. (Heikki A.); Kooner, J. S. (Jaspal S.); Koerner, A. (Antje); Kovacs, P. (Peter); Kuh, D. (Diana); Kumari, M. (Meena); Kutalik, Z. (Zoltan); Laakso, M. (Markku); Lakka, T. A. (Timo A.); Launer, L. J. (Lenore J.); Leander, K. (Karin); Li, H. (Huaixing); Lin, X. (Xu); Lind, L. (Lars); Lindgren, C. (Cecilia); Liu, S. (Simin); Loos, R. J. (Ruth J. F.); Magnusson, P. K. (Patrik K. E.); Mahajan, A. (Anubha); Metspalu, A. (Andres); Mook-Kanamori, D. O. (Dennis O.); Mori, T. A. (Trevor A.); Munroe, P. B. (Patricia B.); Njolstad, I. (Inger); O'Connell, J. R. (Jeffrey R.); Oldehinkel, A. J. (Albertine J.); Ong, K. K. (Ken K.); Padmanabhan, S. (Sandosh); Palmer, C. N. (Colin N. A.); Palmer, N. D. (Nicholette D.); Pedersen, O. (Oluf); Pennell, C. E. (Craig E.); Porteous, D. J. (David J.); Pramstaller, P. P. (Peter P.); Province, M. A. (Michael A.); Psaty, B. M. (Bruce M.); Qi, L. (Lu); Raffel, L. J. (Leslie J.); Rauramaa, R. (Rainer); Redline, S. (Susan); Ridker, P. M. (Paul M.); Rosendaal, F. R. (Frits R.); Saaristo, T. E. (Timo E.); Sandhu, M. (Manjinder); Saramies, J. (Jouko); Schneiderman, N. (Neil); Schwarz, P. (Peter); Scott, L. J. (Laura J.); Selvin, E. (Elizabeth); Sever, P. (Peter); Shu, X.-o. (Xiao-ou); Slagboom, P. E. (P. Eline); Small, K. S. (Kerrin S.); Smith, B. H. (Blair H.); Snieder, H. (Harold); Sofer, T. (Tamar); Sorensen, T. I. (Thorkild I. A.); Spector, T. D. (Tim D.); Stanton, A. (Alice); Steves, C. J. (Claire J.); Stumvoll, M. (Michael); Sun, L. (Liang); Tabara, Y. (Yasuharu); Tai, E. S. (E. Shyong); Timpson, N. J. (Nicholas J.); Tonjes, A. (Anke); Tuomilehto, J. (Jaakko); Tusie, T. (Teresa); Uusitupa, M. (Matti); van der Harst, P. (Pim); van Duijn, C. (Cornelia); Vitart, V. (Veronique); Vollenweider, P. (Peter); Vrijkotte, T. G. (Tanja G. M.); Wagenknecht, L. E. (Lynne E.); Walker, M. (Mark); Wang, Y. X. (Ya X.); Wareham, N. J. (Nick J.); Watanabe, R. M. (Richard M.); Watkins, H. (Hugh); Wei, W. B. (Wen B.); Wickremasinghe, A. R. (Ananda R.); Willemsen, G. (Gonneke); Wilson, J. F. (James F.); Wong, T.-Y. (Tien-Yin); Wu, J.-Y. (Jer-Yuarn); Xiang, A. H. (Anny H.); Yanek, L. R. (Lisa R.); Yengo, L. (Loic); Yokota, M. (Mitsuhiro); Zeggini, E. (Eleftheria); Zheng, W. (Wei); Zonderman, A. B. (Alan B.); Rotter, J. I. (Jerome I.); Gloyn, A. L. (Anna L.); McCarthy, M. I. (Mark I.); Dupuis, J. (Josee); Meigs, J. B. (James B.); Scott, R. A. (Robert A.); Prokopenko, I. (Inga); Leong, A. (Aaron); Liu, C.-T. (Ching-Ti); Parker, S. C. (Stephen C. J.); Mohlke, K. L. (Karen L.); Langenberg, C. (Claudia); Wheeler, E. (Eleanor); Morris, A. P. (Andrew P.); Barroso, I. (Ines) |
| Publisher Information: |
Springer Nature |
| Publication Year: |
2021 |
| Collection: |
Jultika - University of Oulu repository / Oulun yliopiston julkaisuarkisto |
| Description: |
Glycemic traits are used to diagnose and monitor type 2 diabetes and cardiometabolic health. To date, most genetic studies of glycemic traits have focused on individuals of European ancestry. Here we aggregated genome-wide association studies comprising up to 281,416 individuals without diabetes (30% non-European ancestry) for whom fasting glucose, 2-h glucose after an oral glucose challenge, glycated hemoglobin and fasting insulin data were available. Trans-ancestry and single-ancestry meta-analyses identified 242 loci (99 novel; P < 5 x 10-8), 80% of which had no significant evidence of between-ancestry heterogeneity. Analyses restricted to individuals of European ancestry with equivalent sample size would have led to 24 fewer new loci. Compared with single-ancestry analyses, equivalent-sized trans-ancestry fine-mapping reduced the number of estimated variants in 99% credible sets by a median of 37.5%. Genomic-feature, gene-expression and gene-set analyses revealed distinct biological signatures for each trait, highlighting different underlying biological pathways. Our results increase our understanding of diabetes pathophysiology by using trans-ancestry studies for improved power and resolution. |
| Document Type: |
article in journal/newspaper |
| File Description: |
application/pdf |
| Language: |
English |
| ISSN: |
1061-4036; 1546-1718 |
| Relation: |
info:eu-repo/grantAgreement/EC/H2020/633595/EU/Understanding the dynamic determinants of glucose homeostasis and social capability to promote Healthy and active aging/DYNAHEALTH; info:eu-repo/grantAgreement/EC/H2020/733206/EU/Early-life stressors and LifeCycle health/LIFECYCLE; info:eu-repo/grantAgreement/EC/H2020/825762/EU/Metabolic effects of Endocrine Disrupting Chemicals: novel testing METhods and adverse outcome pathways/EDCMET; info:eu-repo/grantAgreement/EC/H2020/824989/EU/A federated FAIR platform enabling large-scale analysis of high-value cohort data connecting Europe and Canada in personalized health/EUCAN-Connect; info:eu-repo/semantics/altIdentifier/pissn/1061-4036; info:eu-repo/semantics/altIdentifier/eissn/1546-1718 |
| Availability: |
http://urn.fi/urn:nbn:fi-fe2022030422054 |
| Rights: |
info:eu-repo/semantics/openAccess ; © The Author(s), under exclusive licence to Springer Nature America, Inc. 2021. This is a post-peer-review, pre-copyedit version of an article published in Nat Genet. The final authenticated version is available online at https://doi.org/10.1038/s41588-021-00852-9. |
| Accession Number: |
edsbas.273E5007 |
| Database: |
BASE |