| Title: |
Épidémiologie moléculaire par séquençage des acides nucléiques d’origine virale présents dans les eaux usées |
| Authors: |
Chen, Juejun; Aherfi, Sarah; Steichen, Pauline; Rios, Géraldine; Waldmann, Rainer; Barbry, Pascal |
| Contributors: |
Institut de pharmacologie moléculaire et cellulaire (IPMC); Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Côte d'Azur (UniCA); Institut Hospitalier Universitaire Méditerranée Infection (IHU Marseille) |
| Source: |
ISSN: 0767-0974. |
| Publisher Information: |
CCSD; EDP Sciences |
| Publication Year: |
2025 |
| Collection: |
HAL Université Côte d'Azur |
| Subject Terms: |
[SDV]Life Sciences [q-bio] |
| Description: |
International audience ; L’analyse métagénomique des acides nucléiques présents dans les eaux usées est un outil épidémiologique prometteur pour suivre la propagation des virus dans de grands bassins démographiques. Son utilisation lors de la pandémie de COVID-19 a permis de surv eiller la circulation du SARS-CoV-2 sans nécessiter la collecte de multiples échantillons individuels. Cette approche permet de suivre non seulement les infections symptomatiques mais aussi les infections asymptomatiques. Initialement basée sur une détection par RT-qPCR, l’introduction du séquençage métagénomique améliore cette détection en fournissant des informations plus détaillées. L’expérience acquise avec la COVID-19 suggère d’étendre désormais cet outil épidémiologique puissant à d’autres virus également détectables dans les eaux usées. Dans cet article, nous décrivons les différentes méthodes mises en œuvre, et nous discutons les enjeux d’un déploiement rapide à une échelle internationale pour mieux appréhender la circulation des virus pathogènes à l’échelle mondiale. |
| Document Type: |
article in journal/newspaper |
| Language: |
French |
| DOI: |
10.1051/medsci/2025083 |
| Availability: |
https://hal.science/hal-05150051; https://hal.science/hal-05150051v1/document; https://hal.science/hal-05150051v1/file/msc240191.pdf; https://doi.org/10.1051/medsci/2025083 |
| Rights: |
https://about.hal.science/hal-authorisation-v1/ ; info:eu-repo/semantics/OpenAccess |
| Accession Number: |
edsbas.2B1E83 |
| Database: |
BASE |