| Title: |
Ancient DNA reveals 4000 years of grapevine diversity, viticulture and clonal propagation in France ; L'ADN ancien révèle 4 000 ans de diversité de la vigne, de la viticulture et de la propagation clonale en France |
| Authors: |
Noraz, Rémi; Chauvey, Lorelei; Wagner, Stefanie; Estrada, Oscar; Wales, Nathan; Bonnaire, Emmanuelle; Cabanis, Manon; Derreumaux, Marie; Figueiral, Isabel; Hallavant, Charlotte; Marinval, Philippe; Matterne, Véronique; Ros, Jérôme; Rovira, Nuria; Tillier, Margaux; Bovagne, Marilyne; Chausserie-Laprée, Jean; Nicolas, Clément; Daveau, Isabelle; Delassus, David; Gailledrat, Eric; Ginouvez, Olivier; Houix, Bertrand; Jung, Cécile; Kuchler, Philippe; Leroux, Laure; Macario, Raphaël; Marlière, Elise; Pasqualini, Michel; Piquès, Gaël; Pomarèdes, Hervé; Robert, Justine; Roms, Cédric; Roth-Zehner, Muriel; Scrinzi, Maxime; Taras-Thomas, Maryanick; Torres Costa, Josep; Besnard, Guillaume; Terral, Jean-Frédéric; Bacilieri, Roberto; Bouby, Laurent; Orlando, Ludovic |
| Contributors: |
Centre d'anthropobiologie et de génomique de Toulouse (CAGT); Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Toulouse (EPE UT); Communauté d'universités et établissements de Toulouse (Comue de Toulouse)-Communauté d'universités et établissements de Toulouse (Comue de Toulouse); Institut des Sciences de l'Evolution de Montpellier (UMR ISEM); Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-École Pratique des Hautes Études (EPHE); Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Institut de recherche pour le développement IRD : UR226-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM); Biodiversité, Gènes & Communautés (BioGeCo); Université de Bordeaux (UB)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE); BioArchéologie, Interactions Sociétés Environnements (BioArch); Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); Archéologie d'Alsace; Institut national de recherches archéologiques préventives (Inrap); Laboratoire de Géographie Physique et Environnementale (GEOLAB); Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP)-Institut Sciences de l'Homme et de la Société (IR SHS UNILIM); Université de Limoges (UNILIM)-Université de Limoges (UNILIM)-Université Clermont Auvergne 2017-2020 (UCA 2017-2020 )-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Clermont Auvergne (UCA); Centre de Recherche Archéologique de la Vallée de l'Oise (CRAVO); Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN); Hadès - Bureau d'Investigations Archéologiques; Archéologie des Sociétés Méditerranéennes (ASM); Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ministère de la Culture (MC)-Université de Montpellier Paul-Valéry (UMPV); IPSO FACTO Marseille; Service archélogique de la ville de Martigues; Ville de Martigues; Mosaïques Archéologie; Service archéologique municipal de Valenciennes; Direction régionale des affaires culturelles - Grand-Est (DRAC Grand-Est); Ministère de la Culture et de la Communication (MCC)-Ministère de la Culture (MC); Archéologies et Sciences de l'Antiquité (ArScAn); Université Paris 1 Panthéon-Sorbonne (UP1)-Université Paris 8 (UP8)-Université Paris Nanterre (UPN)-Ministère de la Culture et de la Communication (MCC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); Antiquarium - Arqueológia y patrimonio; Culture et Environnements, Préhistoire, Antiquité, Moyen-Age (CEPAM); Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Côte d'Azur (UniCA); Archéologie et histoire ancienne : Méditerranée - Europe (ARCHIMEDE); Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Ministère de la Culture et de la Communication (MCC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); Universidad Complutense de Madrid = Complutense University of Madrid Madrid (UCM); Centre de Recherche sur la Biodiversité et l'Environnement (CRBE); Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP); Communauté d'universités et établissements de Toulouse (Comue de Toulouse)-Communauté d'universités et établissements de Toulouse (Comue de Toulouse)-Université de Toulouse (EPE UT); Communauté d'universités et établissements de Toulouse (Comue de Toulouse); Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales (UMR AGAP); Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Montpellier; Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Université de Montpellier (UM); Diversité, Adaptation et Amélioration de la Vigne AGAP (DAAV); Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Université de Montpellier (UM)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Montpellier; This project received funding from the French national research agency (Agence Nationale pour la Recherche), through the VINICULTURE (ANR-16-CE27-0013; LB, LO), MICA (ANR-22-CE27-0026; LB, LO, RN), ISEMA (ANR-23-CE27-0003; J.R. Cine Serra/Ses Feixes project), and ArkaeoAG (ANR-20-CE27-0013; LO) collaborative research projects. Over the course of this study, Ludovic Orlando was supported by the European Research Council (PEGASUS-681605 and HorsePower-101071707), and Roberto Bacillieri work was financially supported by INRAE France.; ANR-22-CE27-0026,MICA,Modéliser les Interactions entre changement Climatique et Agriculture en Occident ancien(2022); ANR-16-CE27-0013,VINICULTURE,Vignes et vins en France du Néolithique au Moyen Age. Approche intégrée en archéosciences(2016); ANR-23-CE27-0003,ISEMA,Déterminer l'impact des changements socio-économiques sur l'agriculture méditerranéenne médiévale(2023); ANR-20-CE27-0013,ArkaeoAG,Histoire, origine et diffusion de l'agriculture: nouvelles preuves de l'archaeobotanie et de la paléogénomique(2020); European Project: 681605,ERC-2015-CoG,ERC-2015-CoG,PEGASUS(2016); European Project: 101071707,ERC-2022-SYG,ERC-2022-SYG,Horsepower(2023) |
| Source: |
ISSN: 2041-1723. |
| Publisher Information: |
CCSD; Nature Publishing Group |
| Publication Year: |
2026 |
| Collection: |
Université Toulouse III - Paul Sabatier: HAL-UPS |
| Subject Terms: |
Population genetics; Plant genetics; Plant evolution; Agricultural genetics; Génétique des populations; Génétique des plantes; Evolution des plantes; Génétique agriculturale; [SHS.ARCHEO]Humanities and Social Sciences/Archaeology and Prehistory; [SDV.GEN.GPL]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Plants genetics; [SDV.GEN.GPO]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Populations and Evolution [q-bio.PE]; [SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences |
| Description: |
Data availability: Demultiplexed sequencing data and alignments against the 12x.2 grape reference genome generated in this study are deposited in the European Nucleotide Archive (ENA) under the following accession code PRJEB94459. Previously published sequencing datasets reanalyzed in this study are available under the following accession codes: PRJNA48997016, PRJNA99917319, PRJCA00931420, PRJNA39361121, PRJNA38829222, PRJNA48519923, PRJNA49031924, PRJNA86842925, PRJNA73159726. ; International audience ; Wine production has deep historical roots in France, yet the biological foundations of early viticulture remain elusive. We report genome-wide ancient DNA data from 49 archaeological grape pips spanning ~4000 years, from the Bronze Age to the Medieval period, primarily focusing on France. Population genetic analyses reveal the genetic makeup of wild local grapevines in the Bronze Age and the early use of domesticated grapevines by ~625-500 BCE. Roman-era genomes reflect long-distance exchange from Iberian, Balkan, Levantine, and Caucasian domesticated varieties. Vegetative propagation, evidenced by genetically identical clones across sites and centuries, emerged by the mid-Iron Age and became a pillar of viticultural practice. Remarkably, one Medieval sample from Valenciennes is genetically identical to modern ‘Pinot Noir’, demonstrating clonal continuity over nearly 600 years. This study traces the introduction, integration and spread of diverse grapevine ancestries that have contributed to shape the varietal landscape of French viticulture. ; La production de vin possède de profondes racines historiques en France, mais les fondements biologiques de la viticulture ancienne restent mal connus. Nous présentons ici des données d’ADN ancien à l’échelle du génome provenant de 49 pépins de raisin archéologiques couvrant environ 4 000 ans, de l’âge du Bronze à la période médiévale, avec un accent particulier sur la France. Les analyses de génétique des populations révèlent la composition génétique des vignes sauvages ... |
| Document Type: |
article in journal/newspaper |
| Language: |
English |
| Relation: |
info:eu-repo/grantAgreement//681605/EU/The makeup of the modern horse: a history of the biological changes introduced by human management/PEGASUS; info:eu-repo/grantAgreement//101071707/EU/Horse Power: Interactions between China, Mongolia and the steppe 2000-0 BCE/Horsepower |
| DOI: |
10.1038/s41467-026-70166-z |
| Availability: |
https://hal.science/hal-05567879; https://hal.science/hal-05567879v1/document; https://hal.science/hal-05567879v1/file/s41467-026-70166-z.pdf; https://doi.org/10.1038/s41467-026-70166-z |
| Rights: |
https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ ; info:eu-repo/semantics/OpenAccess |
| Accession Number: |
edsbas.2CD54C4B |
| Database: |
BASE |