Dieses Ergebnis aus BASE kann Gästen nicht angezeigt werden. Login für vollen Zugriff.

Geographical and temporal distribution of SARS-CoV-2 clades in the WHO European Region, January to June 2020

Title:	Geographical and temporal distribution of SARS-CoV-2 clades in the WHO European Region, January to June 2020
Authors:	Alm E.; Broberg E. K.; Connor T.; Hodcroft E. B.; Komissarov A. B.; Maurer-Stroh S.; Melidou A.; Neher R. A.; O'Toole A.; Pereyaslov D.; Beerenwinkel N.; Posada-Cespedes S.; Jablonski K. P.; Ferreira P. F.; Topolsky I.; Avsic-Zupanc T.; Korva M.; Poljak M.; Zakotnik S.; Zorec T. M.; Bragstad K.; Hungnes O.; Stene-Johansen K.; Reusken C.; Meijer A.; Vennema H.; Ruiz-Roldan L.; Bracho M. A.; Garcia-Gonzalez N.; Chiner-Oms A.; Cancino-Munoz I.; Comas I.; Goig G. A.; Torres-Puente M.; Lopez M. G.; Martinez-Priego L.; D'Auria G.; Ruiz-Hueso P.; Ferrus-Abad L.; de Marco G.; Galan-Vendrell I.; Carbo-Ramirez S.; Ruiz-Rodriguez P.; Coscolla M.; Polackova K.; Kramna L.; Cinek O.; Richter J.; Krashias G.; Tryfonos C.; Bashiardes S.; Koptides D.; Christodoulou C.; Bartolini B.; Gruber C. E.; Di Caro A.; Castilletti C.; Stefani F.; Rimoldi S. G.; Romeri F.; Salerno F.; Polesello S.; Nagy A.; Jirincova H.; Vecerova J.; Novakova L.; Cordey S.; Murtskhvaladze M.; Kotaria N.; Schar T.; Beisel C.; Vugrek O.; Rokic F.; Trgovec-Greif L.; Jurak I.; Rukavina T.; Sucic N.; Schonning K.; Karst S. M.; Kirkegaard R. H.; Michaelsen T. Y.; Sorensen E. A.; Knutson S.; Brandt J.; Le-Quy V.; Sorensen T.; Petersen C.; Pedersen M. S.; Larsen S. L.; Skov M. N.; Rasmussen M.; Fonager J.; Fomsgaard A.; Maksyutov R. A.; Gavrilova E. V.; Pyankov O. V.; Bodnev S. A.; Tregubchak T. V.; Shvalov A. N.; Antonets D. V.; Resende P. C.; Goya S.; Perrin A.; Lee R. T.; Yadahalli S.; Han A. X.; Russell C. A.; Schmutz S.; Zaheri M.; Kufner V.; Huber M.; Trkola A.; Antwerpen M.; Walter M. C.; van der Werf S.; Gambaro F.; Behillil S.; Enouf V.; Donati F.; Ustinova M.; Rovite V.; Klovins J.; Savicka O.; Wienecke-Baldacchino A. K.; Ragimbeau C.; Fournier G.; Mossong J.; Aberle S. W.; Haukland M.; Enkirch T.; Advani A.; Karlberg M. L.; Lindsjo O. K.; Broddesson S.; Slavikova M.; Lickova M.; Klempa B.; Staronova E.; Ticha E.; Szemes T.; Rusnakova D.; Stadler T.; Quer J.; Anton A.; Andres C.; Pinana M.; Garcia-Cehic D.; Pumarola T.; Izopet J.; Gioula G.; Exindari M.; Papa A.; Chatzidimitriou D.; Metallidis S.; Pappa S.; Macek M.; Geryk J.; Broz P.; Briksi A.; Hubacek P.; Drevinek P.; Zajac M.; Kvapil P.; Holub M.; Kvapilova K.; Novotny A.; Kasny M.; Klempt P.; Vapalahti O.; Smura T.; Sironen T.; Selhorst P.; Anthony C.; Arien K.; Simon-Loriere E.; Rabalski L.; Bienkowska-Szewczyk K.; Borges V.; Isidro J.; Gomes J. P.; Guiomar R.; Pechirra P.; Costa I.; Duarte S.; Vieira L.; Pyrc K.; Zuckerman N. S.; Turdikulova S.; Abdullaev A.; Dalimova D.; Abdurakhimov A.; Tagliabracci A.; Alessandrini F.; Melchionda F.; Onofri V.; Turchi C.; Bagnarelli P.; Menzo S.; Caucci S.; Di Sante L.; Popa A.; Genger J. -W.; Agerer B.; Lercher A.; Endler L.; Smyth M.; Penz T.; Schuster M.; Senekowitsch M.; Laine J.; Bock C.; Bergthaler A.; Shevtsov A.; Kalendar R.; Ramanculov Y.; Graf A.; Muenchhoff M.; Keppler O. T.; Krebs S.; Blum H.; Marcello A.; Licastro D.; D'Agaro P.; Laubscher F.; Vidanovic D.; Tesovic B.; Volkening J.; Clementi N.; Mancini N.; Rupnik M.; Mahnic A.; Walker A.; Houwaart T.; Wienemann T.; Vasconcelos M. K.; Strelow D.; Jensen B. -E. O.; Senff T.; Hulse L.; Adams O.; Andree M.; Hauka S.; Feldt T.; Keitel V.; Kindgen-Milles D.; Timm J.; Pfeffer K.; Dilthey A. T.; Moore C.; Ozdarendeli A.; Pavel S. T. I.; Yetiskin H.; Aydin G.; Holyavkin C.; Uygut M. A.; Cevik C.; Shchetinin A.; Gushchin V.; Dinler-Doganay G.; Doganay L.; Kizilboga-Akgun T.; Karacan I.; Pancer K.; Maes P.; Marti-Carreras J.; Wawina-Bokalanga T.; Vanmechelen B.; Thurmer A.; Wedde M.; Durrwald R.; von Kleist M.; Drechsel O.; Wolff T.; Fuchs S.; Kmiecinski R.; Michel J.; Nitsche A.; Casas I.; Caballero M. I.; Zaballos A.; Jimenez P.; Jimenez M.; Fernandez S. M.; Fernandez S. V.; de la Plaza I. C.; Fadeev A.; Ivanova A.; Sergeeva M.; Stefanelli P.; Estee Torok M.; Hall G.; da Silva Filipe A.; Turtle L.; Afifi S.; McCluggage K.; Beer R.; Ledesma J.; Maksimovic J.; Spellman K.; Hamilton W. L.; Marchbank A.; Southgate J. A.; Underwood A.; Taylor B.; Yeats C.; Abudahab K.; Gemmell M. R.; Eccles R.; Lucaci A.; Nelson C. A.; Rainbow L.; Whitehead M.; Gregory R.; Haldenby S.; Paterson S.; Hughes M. A.; Curran M. D.; Baker D.; Tucker R.; Green L. R.; Feltwell T.; Halstead F. D.; Wyles M.; Jahun A. S.; Ahmad S. S. Y.; Georgana I.; Goodfellow I.; Yakovleva A.; Meredith L. W.; Gavriil A.; Awan A. R.; Fisher C.; Edgeworth J.; Lynch J.; Moore N.; Williams R.; Kidd S. P.; Cortes N.; Brunker K.; McCrone J. T.; Quick J.; Duckworth N.; Walsh S.; Sloan T.; Ludden C.; George R. P.; Eltringham G.; Brown J. R.; Aranday-Cortes E.; Shepherd J. G.; Hughes J.; Li K. K.; Williams T. C.; Johnson N.; Jesudason N.; Mair D.; Thomson E.; Shah R.; Parr Y. A.; Carmichael S.; Robertson D. L.; Nomikou K.; Broos A.; Niebel M.; Smollett K.; Tong L.; Miah S.; Wittner A.; Phillips N.; Payne B.; Dewar R.; Holmes A.; Bolt F.; Price J. R.; Mookerjee S.; Sethi D. K.; Potter W.; Stanley R.; Prakash R.; Dervisevic S.; Graham J. C.; Nelson A.; Smith D.; Young G. R.; Yew W. C.; Todd J. A.; Trebes A.; Andersson M.; Bull M.; Watkins J.; Birchley A.; Gatica-Wilcox B.; Gilbert L.; Kumziene-Summerhayes S.; Rey S.; Chauhan A.; Butcher E.; Bicknell K.; Elliott S.; Glaysher S.; Lackenby A.; Bibby D.; Platt S.; Mohamed H.; Machin N. W.; Mbisa J. L.; Evans J.; Perry M.; Pacchiarini N.; Corden S.; Adams A. G.; Gaskin A.; Coombs J.; Graham L. J.; Cottrell S.; Morgan M.; Gifford L.; Kolyva A.; Rudder S. J.; Trotter A. J.; Mather A. E.; Aydin A.; Page A. J.; Kay G. L.; de Oliveira Martins L.; Yasir M.; Alikhan N. -F.; Thomson N. M.; Gilroy R.; Kingsley R. A.; O'Grady J.; Gutierrez A. V.; Diaz M.; Viet T. L.; Tedim A. P.; Adriaenssens E. M.; Patrick Mcclure C.; Sang F.; Clark G.; Howson-Wells H. C.; Debebe J.; Ball J.; Chappell J.; Khakh M.; Carlile M.; Loose M.; Lister M. M.; Holmes N.; Tsoleridis T.; Fleming V. M.; Wright V.; Smith W.; Gallagher M. D.; Parker M.; Partridge D. G.; Evans C.; Baker P.; Essex S.; Liggett S.; Keeley A. J.; Bashton M.; Rooke S.; Dervisavic S.; Meader E. J.; Lopez C. E. B.; Angyal A.; Kristiansen M.; Tutill H. J.; Findlay J.; Mestek-Boukhibar L.; Forrest L.; Dyal P.; Williams R. J.; Panchbhaya Y.; Williams C. A.; Roy S.; Pandey S.; Stockton J.; Loman N. J.; Poplawski R.; Nicholls S.; Rowe W. P. M.; Khokhar F.; Pinckert M. L.; Hosmillo M.; Chaudhry Y.; Caller L. G.; Davidson R. K.; Griffith L.; Rambaut A.; Jackson B.; Colquhoun R.; Hill V.; Nichols J.; Asamaphan P.; Darby A.; Jackson K. A.; Iturriza-Gomara M.; Vamos E. E.; Green A.; Aanensen D.; Bonsall D.; Buck D.; Macintyre-Cockett G.; de Cesare M.; Pybus O.; Golubchik T.; Scarlett G.; Loveson K. F.; Robson S. C.; Beckett A.; Lindsey B.; Groves D. C.; Parsons P. J.; McHugh M. P.; Barnes J. D.; Manso C. F.; Grammatopoulos D.; Menger K. E.; Harrison E.; Gunson R.; Peacock S. J.; Gonzalez G.; Carr M.; Mihaela L.; Popovici O.; Brytting M.; Bresner C.; Fuller W.; Workman T.; Mentis A. F.; Kossyvakis A.; Karamitros T.; Pogka V.; Kalliaropoulos A.; Horefti E.; Kontou A.; Martinez-Gonzalez B.; Labropoulou V.; Voulgari-Kokota A.; Evangelidou M.; Bizta P.; Belimezi M.; Lambrechts L.; Doymaz M. Z.; Yazici M. K.; Cetin N. S.; Karaaslan E.; Kallio-Kokko H.; Virtanen J.; Suvanto M.; Nguyen P. T.; Ellonen P.; Hannula S.; Kangas H.; Sreenu V. B.; Burian K.; Terhes G.; Gombos K.; Gyenesei A.; Urban P.; Herczeg R.; Jakab F.; Kemenesi G.; Toth G. E.; Somogyi B.; Zana B.; Zeghbib S.; Kuczmog A.; Foldes F.; Lanszki Z.; Madai M.; Papp H.; Pereszlenyi C. I.; Babinszky G. C.; Dudas G.; Csoma E.; Abou Tayoun A. N.; Alsheikh-Ali A. A.; Loney T.; Nowotny N.; Abdul-Wahab O.; Gonzalez-Candelas F.; Andersen M. H.; Taylor S.
Contributors:	Alm, E.; Broberg, E. K.; Connor, T.; Hodcroft, E. B.; Komissarov, A. B.; Maurer-Stroh, S.; Melidou, A.; Neher, R. A.; O'Toole, A.; Pereyaslov, D.; Beerenwinkel, N.; Posada-Cespedes, S.; Jablonski, K. P.; Ferreira, P. F.; Topolsky, I.; Avsic-Zupanc, T.; Korva, M.; Poljak, M.; Zakotnik, S.; Zorec, T. M.; Bragstad, K.; Hungnes, O.; Stene-Johansen, K.; Reusken, C.; Meijer, A.; Vennema, H.; Ruiz-Roldan, L.; Bracho, M. A.; Garcia-Gonzalez, N.; Chiner-Oms, A.; Cancino-Munoz, I.; Comas, I.; Goig, G. A.; Torres-Puente, M.; Lopez, M. G.; Martinez-Priego, L.; D'Auria, G.; Ruiz-Hueso, P.; Ferrus-Abad, L.; de Marco, G.; Galan-Vendrell, I.; Carbo-Ramirez, S.; Ruiz-Rodriguez, P.; Coscolla, M.; Polackova, K.; Kramna, L.; Cinek, O.; Richter, J.; Krashias, G.; Tryfonos, C.; Bashiardes, S.; Koptides, D.; Christodoulou, C.; Bartolini, B.; Gruber, C. E.; Di Caro, A.; Castilletti, C.; Stefani, F.; Rimoldi, S. G.; Romeri, F.; Salerno, F.; Polesello, S.; Nagy, A.; Jirincova, H.; Vecerova, J.; Novakova, L.; Cordey, S.; Murtskhvaladze, M.; Kotaria, N.; Schar, T.; Beisel, C.; Vugrek, O.; Rokic, F.; Trgovec-Greif, L.; Jurak, I.; Rukavina, T.; Sucic, N.; Schonning, K.; Karst, S. M.; Kirkegaard, R. H.; Michaelsen, T. Y.; Sorensen, E. A.; Knutson, S.; Brandt, J.; Le-Quy, V.; Sorensen, T.; Petersen, C.; Pedersen, M. S.; Larsen, S. L.; Skov, M. N.; Rasmussen, M.; Fonager, J.; Fomsgaard, A.; Maksyutov, R. A.; Gavrilova, E. V.; Pyankov, O. V.; Bodnev, S. A.; Tregubchak, T. V.; Shvalov, A. N.; Antonets, D. V.
Publication Year:	2020
Collection:	Università degli studi di Trieste: ArTS (Archivio della ricerca di Trieste)
Subject Terms:	COVID-19; Europe; NGS; SARS-CoV-2; WGS; nomenclature; sequencing; Base Sequence; Betacoronaviru; Coronaviru; Coronavirus Infection; Genome; Viral; Human; Phylogeography; Pneumonia; RNA; RNA-Dependent RNA Polymerase; Severe Acute Respiratory Syndrome; Spatio-Temporal Analysi; World Health Organization; Pandemics
Description:	We show the distribution of severe acute respiratory syndrome coronavirus-2 (SARS-CoV-2) genetic clades over time and between countries and outline potential genomic surveillance objectives. We applied three genomic nomenclature systems to all sequence data from the World Health Organization European Region available until 10 July 2020. We highlight the importance of real-time sequencing and data dissemination in a pandemic situation, compare the nomenclatures and lay a foundation for future European genomic surveillance of SARS-CoV-2.
Document Type:	article in journal/newspaper
File Description:	ELETTRONICO
Language:	English
Relation:	info:eu-repo/semantics/altIdentifier/pmid/32794443; info:eu-repo/semantics/altIdentifier/wos/WOS:000563781500002; volume:25; issue:32; firstpage:"-"; lastpage:"-"; numberofpages:8; journal:EUROSURVEILLANCE; https://hdl.handle.net/11368/2993694; https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7427299/
DOI:	10.2807/1560-7917.ES.2020.25.32.2001410
Availability:	https://hdl.handle.net/11368/2993694; https://doi.org/10.2807/1560-7917.ES.2020.25.32.2001410; https://www.eurosurveillance.org/content/10.2807/1560-7917.ES.2020.25.32.2001410; https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7427299/
Rights:	info:eu-repo/semantics/openAccess
Accession Number:	edsbas.33A7C48B
Database:	BASE