| Title: |
Phenotypic spectrum and genomics of undiagnosed arthrogryposis multiplex congenita |
| Authors: |
Laquerriere, Annie; Jaber, Dana; Abiusi, Emanuela; Maluenda, Jérome; Mejlachowicz, Dan; Vivanti, Alexandre; Dieterich, Klaus; Stoeva, Radka; Quevarec, Loic; Nolent, Flora; Biancalana, Valérie; Latour, Philippe; Sternberg, Damien; Capri, Yline; Verloes, Alain; Bessieres, Bettina; Loeuillet, Laurence; Attie-Bitach, Tania; Martinovic, Jelena; Blesson, Sophie; Petit, Florence; Beneteau, Claire; Whalen, Sandra; Marguet, Florent; Bouligand, Jerome; Héron, Delphine; Viot, Géraldine; Amiel, Jeanne; Amram, Daniel; Bellesme, Céline; Bucourt, Martine; Faivre, Laurence; Jouk, Pierre-Simon; Khung, Suonavy; Sigaudy, Sabine; Delezoide, Anne-Lise; Goldenberg, Alice; Jacquemont, Marie-Line; Lambert, Laetitia; Layet, Valérie; Lyonnet, Stanislas; Munnich, Arnold; van Maldergem, Lionel; Piard, Juliette; Guimiot, Fabien; Landrieu, Pierre; Letard, Pascaline; Pelluard, Fanny; Perrin, Laurence; Saint-Frison, Marie-Hélène; Topaloglu, Haluk; Trestard, Laetitia; Vincent-Delorme, Catherine; Amthor, Helge; Barnerias, Christine; Benachi, Alexandra; Bieth, Eric; Boucher, Elise; Cormier-Daire, Valerie; Delahaye-Duriez, Andrée; Desguerre, Isabelle; Eymard, Bruno; Francannet, Christine; Grotto, Sarah; Lacombe, Didier; Laffargue, Fanny; Legendre, Marine; Martin-Coignard, Dominique; Megarbané, André; Mercier, Sandra; Nizon, Mathilde; Rigonnot, Luc; Prieur, Fabienne; Quelin, Chloé; Ranjatoelina-Randrianaivo, Hanitra; Resta, Nicoletta; Toutain, Annick; Verhelst, Helene; Vincent, Marie; Colin, Estelle; Fallet-Bianco, Catherine; Granier, Michèle; Grigorescu, Romulus; Saada, Julien; Gonzales, Marie; Guiochon-Mantel, Anne; Bessereau, Jean-Louis; Tawk, Marcel; Gut, Ivo; Gitiaux, Cyril; Melki, Judith |
| Contributors: |
UNIROUEN - UFR Santé (UNIROUEN UFR Santé); Université de Rouen Normandie (UNIROUEN); Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU); Université Paris-Saclay; Laboratoire de Cancérologie Expérimentale (LCE); Institut de Radiobiologie Cellulaire et Moléculaire (IRCM); Université Paris-Saclay-Institut de Biologie François JACOB (JACOB); Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)); Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)); Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Institut de Biologie François JACOB (JACOB); Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA); GIN Grenoble Institut des Neurosciences (GIN); Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes (UGA); Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse (CRCT); Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3); Communauté d'universités et établissements de Toulouse (Comue de Toulouse)-Communauté d'universités et établissements de Toulouse (Comue de Toulouse)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); Centre Hospitalier Le Mans (CH Le Mans); Laboratoire d'écotoxicologie des radionucléides (IRSN/PSE-ENV/SRTE/LECO); Service de recherche sur les transferts et les effets des radionucléides sur les écosystèmes (IRSN/PSE-ENV/SRTE); Institut de Radioprotection et de Sûreté Nucléaire (IRSN)-Institut de Radioprotection et de Sûreté Nucléaire (IRSN); Institut de Recherche Biomédicale des Armées Brétigny-sur-Orge (IRBA); Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire (IGBMC); Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); Hospices Civils de Lyon (HCL); Centre de recherche en Myologie – U974 SU-INSERM; Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU); Institut de Myologie; Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Association française contre les myopathies (AFM-Téléthon)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); Hôpital Robert Debré; Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP); Hôpital Necker - Enfants Malades AP-HP; UFR Médecine Santé - Université Paris Cité (UFR Médecine UPCité); Université Paris Cité (UPCité); Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5); Imagine - Institut des maladies génétiques (IHU) (Imagine - U1163); Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité); AP-HP - Hôpital Antoine Béclère Clamart; Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours); Maladies RAres du DEveloppement embryonnaire et du MEtabolisme : du Phénotype au Génotype et à la Fonction - ULR 7364 (RADEME); Université de Lille-Centre Hospitalier Régional Universitaire CHU Lille (CHRU Lille); Centre Hospitalier Universitaire de Nantes = Nantes University Hospital (CHU Nantes); CHU Trousseau APHP; Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU); Département de Pathologie CHU Rouen; CHU Rouen; Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN); Normandie Université (NU); Team 4 NeoVasc - Region Team ERI 28 INSERM (Neovasc); Génomique et Médecine Personnalisée du Cancer et des Maladies Neuropsychiatriques (GPMCND); Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN); Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM); Physiologie et physiopathologie endocriniennes (PHYSENDO); 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Université Grenoble Alpes (UGA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP); Université Grenoble Alpes (UGA); Maladies neurodéveloppementales et neurovasculaires (NeuroDiderot (UMR_S_1141 / U1141)); CHU Marseille; Hôpital de la Timone CHU - APHM (TIMONE); Service de Génétique CHU Rouen; Centre Hospitalier Universitaire de La Réunion (CHU La Réunion); V MANE Fils; Groupe Hospitalier du Havre; Centre de génétique humaine CHRU Besançon; Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon); Molecular and pathophysiological bases of cognitive disorders (Equipe Inserm U1163); Imagine - Institut des maladies génétiques (IMAGINE - U1163); Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM); Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM); Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM); Bordeaux Research In Translational Oncology Bordeaux (BaRITOn); Université de Bordeaux (UB)-Centre Hospitalier Universitaire de Bordeaux (CHU Bordeaux)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM); Centre Hospitalier Universitaire de Bordeaux (CHU Bordeaux); Département de génétique Robert Debré |
| Source: |
ISSN: 0022-2593. |
| Publisher Information: |
CCSD; BMJ Publishing Group |
| Publication Year: |
2021 |
| Collection: |
Université de Nantes: HAL-UNIV-NANTES |
| Subject Terms: |
neuromuscular diseases; nervous system malformations; human genetics; genomics; MESH: Arthrogryposis* / diagnosis; MESH: Arthrogryposis* / genetics; MESH: Proteins / genetics; MESH: Repressor Proteins; MESH: Transcription Factors / genetics; MESH: Arthrogryposis* / pathology; MESH: Exome Sequencing; MESH: Genomics; MESH: Humans; MESH: Intracellular Signaling Peptides and Proteins; MESH: Intrinsically Disordered Proteins; MESH: Pedigree; MESH: Phenotype; [SDV.BBM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry; Molecular Biology |
| Description: |
BACKGROUND: Arthrogryposis multiplex congenita (AMC) is characterised by congenital joint contractures in two or more body areas. AMC exhibits wide phenotypic and genetic heterogeneity. Our goals were to improve the genetic diagnosis rates of AMC, to evaluate the added value of whole exome sequencing (WES) compared with targeted exome sequencing (TES) and to identify new genes in 315 unrelated undiagnosed AMC families. METHODS: Several genomic approaches were used including genetic mapping of disease loci in multiplex or consanguineous families, TES then WES. Sanger sequencing was performed to identify or validate variants. RESULTS: We achieved disease gene identification in 52.7% of AMC index patients including nine recently identified genes (CNTNAP1, MAGEL2, ADGRG6, ADCY6, GLDN, LGI4, LMOD3, UNC50 and SCN1A). Moreover, we identified pathogenic variants in ASXL3 and STAC3 expanding the phenotypes associated with these genes. The most frequent cause of AMC was a primary involvement of skeletal muscle (40%) followed by brain (22%). The most frequent mode of inheritance is autosomal recessive (66.3% of patients). In sporadic patients born to non-consanguineous parents (n=60), de novo dominant autosomal or X linked variants were observed in 30 of them (50%). CONCLUSION: New genes recently identified in AMC represent 21% of causing genes in our cohort. A high proportion of de novo variants were observed indicating that this mechanism plays a prominent part in this developmental disease. Our data showed the added value of WES when compared with TES due to the larger clinical spectrum of some disease genes than initially described and the identification of novel genes. |
| Document Type: |
article in journal/newspaper |
| Language: |
English |
| Relation: |
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/pmid/33820833; PUBMED: 33820833; PUBMEDCENTRAL: PMC9132874 |
| DOI: |
10.1136/jmedgenet-2020-107595 |
| Availability: |
https://hal.science/hal-03708085; https://hal.science/hal-03708085v1/document; https://hal.science/hal-03708085v1/file/PDF%20Datastream.pdf; https://doi.org/10.1136/jmedgenet-2020-107595 |
| Rights: |
https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/ ; info:eu-repo/semantics/OpenAccess |
| Accession Number: |
edsbas.6DD4BF1A |
| Database: |
BASE |