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Antiretroviral-naive and -treated HIV-1 patients can harbour more resistant viruses in CSF than in plasma

Title: Antiretroviral-naive and -treated HIV-1 patients can harbour more resistant viruses in CSF than in plasma
Authors: Soulié, Cathia; Descamps, Diane; Ronique Schneider, Vé; Trabaud, Mary-Anne; Morand-Joubert, Laurence; Delaugerre, Constance; Montes, Brigitte; Barin, Francis; Ferré, Virginie; Maillard, Anne; Vallet, Sophie; Roussel, Catherine; Assoumou, Lambert; Calvez, Vincent; Flandre, Philippe; Ve, Anne-Geneviè; Jeulin, H.; Guigon, A.; Lagier, E.; Le Guillou, H.; Alloui, C.; Bettinger, D.; Pallier, C.; Fleury, H.; Reigadas, S.; Bellecave, P.; Recordon-Pinson, P.; Payan, C.; Vabret, A.; Henquell, C.; Mirand, A.; Bouvier-Alias, M.; de Rougemont, Alexis; dos Santos, G.; Morand, P.; Signori-Schmuck, A.; Bocket, L.; Rogez, S.; Andre, P.; Tardy, J.; Tamalet, C.; Delamare, C.; Schvoerer, E.; André-Garnier, E.; Cottalorda, J.; Guinard, J.; Guiguon, A.; Brun-Vezinet, F.; Charpentier, C.; Visseaux, B.; Peytavin, G.; Krivine, A.; Si-Mohamed, A.; Avettand-Fenoel, V.; Marcelin, A.-G.; Lambert-Niclot, S.; Wirden, M.; Chaix, M.; Amiel, C.; Schneider, V.; Giraudeau, G.; Brodard, V.; Plantier, J.; Chaplain, C.; Bourlet, T.; Fafi-Kremer, S.; Stoll-Keller, F.; Schmitt, M.; Barth, H.; Yerly, S.; Poggi, C.; Izopet, Jacques; Raymond, S.; Chaillon, A.; Marque-Juillet, S.; Roque-Afonso, A.; Haim-Boukobza, S.; Grude, Maxime; Costagliola, D.; Allegre, T.; Schmit, J.; Chennebault, J.; Bouchaud, O.; Magy-Bertrand, N.; Delfraissy, J.; Dupon, M.; Morlat, P.; Neau, D.; Ansart, S.; Jaffuel, S.; Verdon, R.; Jacomet, C.; Levy, Y.; Dominguez, S.; Chavanet, P.; Piroth, L.; Cabié, A.; Leclercq, P.; Ajana, F.; Cheret, A.; Weinbreck, P.; Cotte, L.; Poizot-Martin, I.; Ravaud, I.; Christian, B.; Truchetet, F.; Grandidier, M.; Reynes, J.; May, T.; Goehringer, F.; Raffi, F.; Dellamonica, P.; Prazuck, T.; Hocqueloux, L.; Yeni, P.; Landman, R.; Launay, O.; Weiss, L.; Viard, J.; Katlama, C.; Simon, A.; Girard, Pascal; Meynard, J.; Molina, J.; Pialoux, G.; Hoen, B.; Goeger-Sow, M.; Lamaury, I.; Beaucaire, G.; Jaussaud, R.; Rouger, C.; Michelet, C.; Borsa-Lebas, F.; Caron, F.; Khuong, M.; Lucht, F.; Rey, D.; Calmy, A.; Marchou, B.; Gras, G.; Greder-Belan, A.; Vittecoq, D.; Teicher, E.
Contributors: Epidémiologie, stratégies thérapeutiques et virologie cliniques dans l'infection à VIH; Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM); Laboratoire de Virologie; Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard Paris; Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP); CHU Saint-Antoine AP-HP; Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU); Génétique et Ecologie des Virus, Génétique des Virus et Pathogénèse des Maladies Virales; Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM); Centre Hospitalier Régional Universitaire Montpellier (CHRU Montpellier); Morphogénèse et antigénicité du VIH, des Virus des Hépatites et Emergents (MAVIVHe); Université de Tours (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM); Centre Hospitalier Universitaire de Nantes = Nantes University Hospital (CHU Nantes); Centre Hospitalier Universitaire de Rennes CHU Rennes = Rennes University Hospital Pontchaillou; Laboratoire de Parasitologie et Mycologiede CHRU Brest; Centre Hospitalier Régional Universitaire de Brest (CHRU Brest); Service de Bactériologie-Virologie-Hygiène CHRU Tours; Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours); Modélisation mathématique, calcul scientifique (MMCS); Institut Camille Jordan (ICJ); École Centrale de Lyon (ECL); Université de Lyon-Université de Lyon-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL); Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon); Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Centrale de Lyon (ECL); Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); Service de Virologie CHRU Nancy; Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy); Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon); Neuroimagerie cognitive (LCogn); Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM); Microbiologie Fondamentale et Pathogénicité (MFP); Université de Bordeaux (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); Université Grenoble Alpes 2016-2019 (UGA 2016-2019 ); Laboratoire de Virologie Humaine et Moléculaire Caen; CHU Caen Normandie – Centre Hospitalier Universitaire de Caen Normandie (CHU Caen Normandie); Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU); Faculté de médecine et pharmacie; CHU Clermont-Ferrand; Institut Mondor de Recherche Biomédicale (IMRB); Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12); UFR des Sciences de Santé (Université de Bourgogne); Université de Bourgogne (UB); Centre National de Référence des virus entériques CHU de Dijon (CNR virus entériques); Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon); Laboratoire de sérologie-virologie (CHU de Dijon); Procédés Alimentaires et Microbiologiques Dijon (PAM); Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté COMUE (UBFC); Institut de biologie et chimie des protéines Lyon (IBCP); Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL); Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); Unit of Virus Host Cell Interactions = Biologie structurale des interactions entre virus et cellule hôte (UVHCI); Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-European Molecular Biology Laboratory Grenoble (EMBL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); CHU Limoges; Laboratoire d'Informatique de Nantes Atlantique (LINA); Mines Nantes (Mines Nantes)-Université de Nantes - UFR des Sciences et des Techniques (UN UFR ST); Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); Laboratoire d'électronique, optoélectronique et microsystèmes (LEOM); Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes (URMITE); Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR48; Institut des sciences biologiques - CNRS Biologie (INSB-CNRS)-Institut des sciences biologiques - CNRS Biologie (INSB-CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); Hôtel-Dieu de Nantes; Service de chirurgie pédiatrique Hôpital Lapeyronie-Arnaud de Villeneuve; Hôpital Lapeyronie CHU Montpellier; Centre Hospitalier Régional Universitaire Montpellier (CHRU Montpellier)-Centre Hospitalier Régional Universitaire Montpellier (CHRU Montpellier); Infection, Anti-microbiens, Modélisation, Evolution (IAME (UMR_S_1137 / U1137)); Université Paris 13 (UP13)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM); AP-HP - Hôpital Cochin Broca Hôtel Dieu Paris; Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique (iPLESP); Equipe de Recherche en Physico-Chimie et Biotechnologie (ERPCB); Université de Caen Normandie (UNICAEN); Interactions et dynamique des environnements de surface (IDES); Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); Laboratoire de Virologie Strasbourg; Interactions Virus-Hôte et Maladies Hépatiques; Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM); Environment and Sustainable Development Programme; European Commission - DG Research and Innovation; Centre Hospitalier Intercommunal de Toulon La Seyne-sur-Mer; Laboratoire Virologie CHU Toulouse; Institut Fédératif de Biologie (IFB); Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Pôle Biologie CHU Toulouse; Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse); Magnétisme et Diffusion Neutronique (MDN); Modélisation et Exploration des Matériaux (MEM); Université Grenoble Alpes 2016-2019 (UGA 2016-2019 )-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG); Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)); Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)); Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Grenoble Alpes 2016-2019 (UGA 2016-2019 )-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG)
Source: ISSN: 0305-7453.
Publisher Information: CCSD; Oxford University Press (OUP)
Publication Year: 2015
Collection: Université François-Rabelais de Tours: HAL
Subject Terms: ARV; HIV; resistance; CSF; [SDV.MP.VIR]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Virology; [SDV.MHEP.MI]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases
Description: International audience ; Objectives: The neurological disorders in HIV-1-infected patients remain prevalent. The HIV-1 resistance in plasma and CSF was compared in patients with neurological disorders in a multicentre study. Methods: Blood and CSF samples were collected at time of neurological disorders for 244 patients. The viral loads were .50 copies/mL in both compartments and bulk genotypic tests were realized. Results: On 244 patients, 89 and 155 were antiretroviral (ARV) naive and ARV treated, respectively. In ARV-naive patients, detection of mutations in CSF and not in plasma were reported for the reverse transcriptase (RT) gene in 2/89 patients (2.2%) and for the protease gene in 1/89 patients (1.1%). In ARV-treated patients, 19/152 (12.5%) patients had HIV-1 mutations only in the CSF for the RT gene and 30/151 (19.8%) for the protease gene. Two mutations appeared statistically more prevalent in the CSF than in plasma: M41L (P ¼ 0.0455) and T215Y (P ¼0.0455). Conclusions: In most cases, resistance mutations were present and similar in both studied compartments. However, in 3.4% of ARV-naive and 8.8% of ARV-treated patients, the virus was more resistant in CSF than in plasma. These results support the need for genotypic resistance testing when lumbar puncture is performed.
Document Type: article in journal/newspaper
Language: English
DOI: 10.1093/jac/dku419
Availability: https://ube.hal.science/hal-02291062; https://ube.hal.science/hal-02291062v1/document; https://ube.hal.science/hal-02291062v1/file/Soulie%20C%20et%20al%20-%20JAC%202015.pdf; https://doi.org/10.1093/jac/dku419
Rights: https://about.hal.science/hal-authorisation-v1/ ; info:eu-repo/semantics/OpenAccess
Accession Number: edsbas.94E148D7
Database: BASE