| Description: |
Cette thèse s’inscrit dans un contexte de transition vers une agriculture plus durable nécessitant le développement de pratiques agricoles respectueuses de la santé humaine et de l’environnement, notamment en réduisant l’usage des pesticides chimiques. L’utilisation des champignons mycorhiziens à arbuscules (CMA), comme potentiels agents de biocontrôle, représente une alternative prometteuse aux fongicides chimiques. Ainsi, ce travail a pour objectif d’évaluer la capacité du CMA Funneliformis mosseae à induire une protection systémique chez le blé contre Zymoseptoria tritici, champignon hémibiotrophe, responsable de la septoriose, maladie foliaire majeure en région Hauts-de-France. Cette thèse vise, notamment à : (i) analyser les modifications transcriptomiques induites par F. mosseae au niveau foliaire, au cours de l’établissement de la symbiose mycorhizienne dans les racines ; (ii) comprendre les mécanismes moléculaires foliaires impliqués dans la protection du blé contre la septoriose, induits par F. mosseae; et (iii) caractériser les communautés microbiennes associées aux racines et à la rhizosphère de 3 plantes, dont le blé, cultivés sur un sol issu de champs de blé de notre région. Nos résultats ont montré que parallèlement à l’augmentation de la colonisation racinaire, une réponse systémique est observée dans les feuilles de blé dès le 19e jour de culture, avec une activation marquée de l’expression de nombreux gènes des tissus foliaires à partir du 42e jour de co-culture. Bien que la biomasse des plantes ne soit pas affectée par la mycorhization des racines de blé, plusieurs voies métaboliques sont stimulées (mobilisation des phosphates, protéolyse, métabolisme du C, photorespiration, mécanismes antioxydants, voies hormonales de signalisation liées à l’ABA, l’AJ et l’ET, activation de gènes de défense). Un grand nombre de ces mêmes gènes est également induit dans les feuilles de blé en réponse à l’inoculation par Z. tritici. Par ailleurs, une répression des gènes codant des protéines impliquées dans la ... |