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Mise au point d’outils pour l’étude protéomique de la protéine ORF3 du virus de la diarrhée épidémique porcine

Title: Mise au point d’outils pour l’étude protéomique de la protéine ORF3 du virus de la diarrhée épidémique porcine
Authors: Bigault, Lionel; Percevault, Ludivine; Marchat, Océane; Lore, Sarah; Blanchard, Yannick; Contrant, Maud
Contributors: Laboratoire de Ploufragan-Plouzané-Niort ANSES; Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES); Génétique Virale et Biosécurité (GVB); Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES)-Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES); Société Française de Virologie
Source: XXVIes Journées francophones de virologie ; https://anses.hal.science/anses-04694276 ; XXVIes Journées francophones de virologie, Apr 2024, Liège, Belgique. 2024
Publisher Information: CCSD
Publication Year: 2024
Collection: Anses: HAL (Agence nationale de sécurité sanitaire de l’alimentation, de l’environnement et du travail)
Subject Terms: Virus de la diarrhée épidémique porcine; [SDV]Life Sciences [q-bio]
Subject Geographic: Liège; Belgium
Description: International audience ; L’épidémie de SARS-CoV-2, troisième émergence à coronavirus chez l’humain ces 20 dernières années, a dramatiquement remis en lumière l’importance du potentiel zoonotique des Coronaviridae. Répartis en 4 genres, Alpha, Beta, Delta et Gamma, les deux premiers sont retrouvés parmi les mammifères, et les deux derniers essentiellement chez les volailles. Les coronavirus partagent une organisation génomique commune, avec les deux premiers tiers du génome codant le complexe de réplication, suivis par les séquences codant les protéines structurales. Suivant les genres, une ou plusieurs séquences codant des protéines dites accessoires sont intercalées entre les gènes structuraux. À l’exception des Deltacoronavirus, au moins une ORF accessoire est nichée entre les gènes Spicule et Enveloppe. Le produit de l’une de ces ORF, située entre les séquences codantes des protéine S et E, majoritairement nommée ORF3 et présente chez les Alpha et une majorité de Betacoronavirus, serait directement impliqué dans la virulence et la régulation du cycle infectieux. La protéine codée par l’ORF3 est essentiellement caractérisée chez les betacoronavirus SARS-CoV-1 et 2. Afin d’étendre nos connaissances sur ces protéines accessoires, nos travaux portent sur la protéine ORF3 de l’alphacoronavirus de la diarrhée épidémique porcine (PEDV). Notre équipe développe les outils moléculaires adéquats pour la recherche de ses partenaires protéiques, ainsi qu’un protocole d’infection sur organoïdes intestinaux de porcs, modèle cellulaire plus représentatif des conditions réelles d’infection que la culture sur cellule Vero. La recherche et l’identification des interactants seront réalisées parspectrométrie de masse, grâce à un système d’expression et de co-immunoprécipitation de la protéine d’intérêt. Un outil de génétique inverse, en cours de finalisation, permettra de valider nos résultats dans un contexte infectieux, et d’étendre la caractérisation de cette protéine à des souches difficilement cultivables.
Document Type: conference object; still image
Language: French
Availability: https://anses.hal.science/anses-04694276
Accession Number: edsbas.A2DC82C1
Database: BASE