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The HIV-1 Integrase C-Terminal domain induces TAR RNA structural changes promoting Tat binding

Title: The HIV-1 Integrase C-Terminal domain induces TAR RNA structural changes promoting Tat binding
Authors: Rocchi, Cecilia; Louvat, Camille; Miele, Adriana; Batisse, Julien; Guillon, Christophe; Ballut, Lionel; Lener, Daniela; Negroni, Matteo; RUFF, Marc; Gouet, Patrice; Fiorini, Francesca
Contributors: Microbiologie moléculaire et biochimie structurale / Molecular Microbiology and Structural Biochemistry (MMSB); Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL); Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); Institut des Sciences Analytiques (ISA); Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL); Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire (IGBMC); Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); Architecture et Réactivité de l'ARN (ARN); Institut de biologie moléculaire et cellulaire (IBMC); Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); Institut de génétique et biologie moléculaire et cellulaire (IGBMC); Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); BioSciences Lyon-Gerland (BLG); École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL); Université de Lyon-Université de Lyon-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Source: https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03434126 ; 2021.
Publisher Information: HAL CCSD
Publication Year: 2021
Collection: Archive ouverte HAL (Hyper Article en Ligne, CCSD - Centre pour la Communication Scientifique Directe)
Subject Terms: [SDV]Life Sciences [q-bio]
Description: Recent evidence indicated that HIV-1 Integrase (IN) binds genomic viral RNA (gRNA) playing a critical role in viral particle morphogenesis and gRNA stability in host cells. Combining biophysical and biochemical approaches we show that the C-terminal flexible 18-residues tail of IN acts as a sensor of the peculiar apical structure of trans-activation response element RNA (TAR), directly interacting with its hexaloop. We highlighted how the whole IN C-terminal domain, once bound to TAR, can change its structure assisting the binding of Tat, the HIV trans-activator protein, which finally displaces IN from TAR. Our results are consistent with the emerging role of IN in early stage of proviral transcription and suggest new steps of HIV-1 life cycle that can be considered as therapeutic targets.
Document Type: report
Language: English
Relation: hal-03434126; https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03434126; https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03434126/document; https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03434126/file/Rocchi-Louvat-MS-NatCommun.pdf
Availability: https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03434126; https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03434126/document; https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03434126/file/Rocchi-Louvat-MS-NatCommun.pdf
Rights: info:eu-repo/semantics/OpenAccess
Accession Number: edsbas.A976F4EC
Database: BASE