Pathogen-sugar interactions revealed by universal saturation transfer analysis
| Title: | Pathogen-sugar interactions revealed by universal saturation transfer analysis |
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| Authors: | Buchanan CJ; Gaunt B; Harrison PJ; Yang Y; Liu J; Khan A; Giltrap AM; Le Bas A; Ward PN; Gupta K; Dumoux M; Tan TK; Schimaski L; Daga S; Picchiotti N; Baldassarri M; Benetti E; Fallerini C; Fava F; Giliberti A; Koukos PI; Davy MJ; Lakshminarayanan A; Xue X; Papadakis G; Deimel LP; Casablancas-Antràs V; Claridge TDW; Bonvin AMJJ; Sattentau QJ; Furini S; Gori M; Huo J; Owens RJ; Schaffitzel C; Berger I; Renieri A; Francesca Montagnani; Mario Tumbarello; Ilaria Rancan; Massimiliano Fabbiani; Elena Bargagli; Laura Bergantini; Miriana D’Alessandro; Paolo Cameli; David Bennett; Sabino Scolletta; Federico Franchi; Federico Anedda; Simona Marcantonio; Maria Antonietta Mazzei; Susanna Guerrini; Edoardo Conticini; Luca Cantarini; Bruno Frediani; Danilo Tacconi; Chiara Spertilli Raffaelli; Marco Feri; Alice Donati; Raffaele Scala; Luca Guidelli; Genni Spargi; Marta Corridi; Cesira Nencioni; Leonardo Croci; Gian Piero Caldarelli; Davide Romani; Paolo Piacentini; Maria Bandini; Elena Desanctis; Silvia Cappelli; Anna Canaccini; Agnese Verzuri; Valentina Anemoli; Manola Pisani; Agostino Ognibene; Alessandro Pancrazzi; Maria Lorubbio; Massimo Vaghi; Antonella D’Arminio Monforte; Federica Gaia Miraglia; Mario U. Mondelli; Marco Vecchia; Stefania Mantovani; Raffaele Bruno; Marcello Maffezzoni; Massimo Girardis; Sophie Venturelli; Stefano Busani; Andrea Cossarizza; Andrea Antinori; Alessandra Vergori; Arianna Emiliozzi; Stefano Rusconi; Matteo Siano; Arianna Gabrieli; Agostino Riva; Daniela Francisci; Elisabetta Schiaroli; Andrea Tommasi; Pier Giorgio Scotton; Francesca Andretta; Sandro Panese; Stefano Baratti; Renzo Scaggiante; Francesca Gatti; Saverio Giuseppe Parisi; Francesco Castelli; Eugenia Quiros-Roldan; Melania Degli Antoni; Isabella Zanella; Matteo Della Monica; Carmelo Piscopo; Mario Capasso; Roberta Russo; Immacolata Andolfo; Achille Iolascon; Giuseppe Fiorentino; Massimo Carella; Marco Castori; Giuseppe Merla; Gabriella Maria Squeo; Filippo Aucella; Pamela Raggi; Rita Perna; Matteo Bassetti; Antonio Di Biagio; Maurizio Sanguinetti; Luca Masucci; Alessandra Guarnaccia; Serafina Valente; Alex Di Florio; Francesca Mari; Mirella Bruttini; Ilaria Meloni; Susanna Croci; Gabriella Doddato; Flavia Privitera; Loredaria Adamo; Viola Bianca Serio; Enrica Antonili; Mirjam Lista; Giada Beligni; Debora Maffeo; Elena Pasquinelli; Kristina Zguro; Giulia Brunelli; Rossella Tita; Maria Antonietta Mencarelli; Caterina Lo Rizzo; Anna Maria Pinto; Francesca Ariani; Marco Mandalà; Alessia Giorli; Lorenzo Salerni; Patrizia Zucchi; Pierpaolo Parravicini; Elisabetta Menatti; Tullio Trotta; Ferdinando Giannattasio; Gabriella Coiro; Fabio Lena; Gianluca Lacerenza; Cristina Mussini; Enrico Martinelli; Luisa Tavecchia; Lia Crotti; Gianfranco Parati; Roberto Menè; Maurizio Sanarico; Francesco Raimondi; Alessandra Stella; Filippo Biscarini; Tiziana Bachetti; Maria Teresa La Rovere; Maurizio Bussotti; Serena Ludovisi; Katia Capitani; Chiara Gabbi; Simona Dei; Sabrina Ravaglia; Rosangela Artuso; Elena Andreucci; Giulia Gori; Angelica Pagliazzi; Erika Fiorentini; Antonio Perrella; Francesco Bianchi; Paola Bergomi; Emanuele Catena; Riccardo Colombo; Sauro Luchi; Giovanna Morelli; Paola Petrocelli; Sarah Iacopini; Sara Modica; Silvia Baroni; Giulia Micheli; Marco Falcone; Giusy Tiseo; Chiara Barbieri; Tommaso Matucci; Davide Grassi; Claudio Ferri; Franco Marinangeli; Francesco Brancati; Antonella Vincenti; Valentina Borgo; Stefania Lombardi; Mirco Lenzi; Massimo Antonio Di Pietro; Francesca Vichi; Benedetta Romanin; Letizia Attala; Cecilia Costa; Andrea Gabbuti; Marta Colaneri; Patrizia Casprini; Cristoforo Pomara; Massimiliano Esposito; Lucrezia Galasso; Michele Cirianni; Roberto Leoncini; Marco Antonio Bellini; Alessio Bellucci; Naismith JH; Baldwin AJ; Davis BG |
| Contributors: | Buchanan, Cj; Gaunt, B; Harrison, Pj; Yang, Y; Liu, J; Khan, A; Giltrap, Am; Le Bas, A; Ward, Pn; Gupta, K; Dumoux, M; Tan, Tk; Schimaski, L; Daga, S; Picchiotti, N; Baldassarri, M; Benetti, E; Fallerini, C; Fava, F; Giliberti, A; Koukos, Pi; Davy, Mj; Lakshminarayanan, A; Xue, X; Papadakis, G; Deimel, Lp; Casablancas-Antràs, V; Tdw, Claridge; Amjj, Bonvin; Sattentau, Qj; Furini, S; Gori, M; Huo, J; Owens, Rj; Schaffitzel, C; Berger, I; Renieri, A; Montagnani, Francesca; Tumbarello, Mario; Rancan, Ilaria; Fabbiani, Massimiliano; Bargagli, Elena; Bergantini, Laura; D’Alessandro, Miriana; Cameli, Paolo; Bennett, David; Scolletta, Sabino; Franchi, Federico; Anedda, Federico; Marcantonio, Simona; Mazzei, MARIA ANTONIETTA; Guerrini, Susanna; Conticini, Edoardo; Cantarini, Luca; Frediani, Bruno; Tacconi, Danilo; Chiara Spertilli Raffaelli; Feri, Marco; Donati, Alice; Scala, Raffaele; Guidelli, Luca; Spargi, Genni; Corridi, Marta; Nencioni, Cesira; Croci, Leonardo; Gian Piero Caldarelli; Romani, Davide; Piacentini, Paolo; Bandini, Maria; Desanctis, Elena; Cappelli, Silvia; Canaccini, Anna; Verzuri, Agnese; Anemoli, Valentina; Pisani, Manola; Ognibene, Agostino; Pancrazzi, Alessandro; Lorubbio, Maria; Vaghi, Massimo; Antonella D’Arminio Monforte; Federica Gaia Miraglia; Mondelli, Mario U.; Vecchia, Marco; Mantovani, Stefania; Bruno, Raffaele; Maffezzoni, Marcello; Girardis, Massimo; Venturelli, Sophie; Busani, Stefano; Cossarizza, Andrea; Antinori, Andrea; Vergori, Alessandra; Emiliozzi, Arianna; Rusconi, Stefano; Siano, Matteo; Gabrieli, Arianna; Riva, Agostino; Francisci, Daniela; Schiaroli, Elisabetta; Tommasi, Andrea |
| Publication Year: | 2022 |
| Collection: | Università degli Studi di Siena: USiena air |
| Subject Terms: | COVID-19; Cryoelectron Microscopy; Human; SARS-CoV-2; Spike Glycoprotein; Coronaviru; Sugars |
| Description: | Many pathogens exploit host cell-surface glycans. However, precise analyses of glycan ligands binding with heavily modified pathogen proteins can be confounded by overlapping sugar signals and/or compounded with known experimental constraints. Universal saturation transfer analysis (uSTA) builds on existing nuclear magnetic resonance spectroscopy to provide an automated workflow for quantitating protein-ligand interactions. uSTA reveals that early-pandemic, B-origin-lineage severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) spike trimer binds sialoside sugars in an “end-on” manner. uSTA-guided modeling and a high-resolution cryo–electron microscopy structure implicate the spike N-terminal domain (NTD) and confirm end-on binding. This finding rationalizes the effect of NTD mutations that abolish sugar binding in SARS-CoV-2 variants of concern. Together with genetic variance analyses in early pandemic patient cohorts, this binding implicates a sialylated polylactosamine motif found on tetraantennary N-linked glycoproteins deep in the human lung as potentially relevant to virulence and/or zoonosis. |
| Document Type: | article in journal/newspaper |
| File Description: | ELETTRONICO |
| Language: | English |
| Relation: | info:eu-repo/semantics/altIdentifier/pmid/35737812; info:eu-repo/semantics/altIdentifier/wos/WOS:000830834600030; volume:377; issue:6604; numberofpages:18; journal:SCIENCE; https://hdl.handle.net/11365/1225539 |
| DOI: | 10.1126/science.abm3125 |
| Availability: | https://hdl.handle.net/11365/1225539; https://doi.org/10.1126/science.abm3125; https://www.science.org/doi/10.1126/science.abm3125 |
| Rights: | info:eu-repo/semantics/openAccess |
| Accession Number: | edsbas.C2F4DACC |
| Database: | BASE |