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Metagenomics and population genomics of honey bees through the direct sequencing of honeys

Title: Metagenomics and population genomics of honey bees through the direct sequencing of honeys
Authors: Teixido, Noemie; Simon, Elisa; Labarthe, Emmanuelle; Rottier, Emilien; Basso, Benjamin, B.; Mondet, Fanny; Vignal, Alain; Canale Tabet, Kamila; Leroy, Thibault
Contributors: Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE); École nationale vétérinaire de Toulouse (ENVT); Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP); Communauté d'universités et établissements de Toulouse (Comue de Toulouse)-Communauté d'universités et établissements de Toulouse (Comue de Toulouse)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP); Communauté d'universités et établissements de Toulouse (Comue de Toulouse)-Communauté d'universités et établissements de Toulouse (Comue de Toulouse)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse (ENSAT, INP-ENSAT, AgroToulouse, INP-AgroToulouse); Communauté d'universités et établissements de Toulouse (Comue de Toulouse)-Communauté d'universités et établissements de Toulouse (Comue de Toulouse)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INP - PURPAN); Communauté d'universités et établissements de Toulouse (Comue de Toulouse)-Communauté d'universités et établissements de Toulouse (Comue de Toulouse)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE); Abeilles et Environnement (AE); Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE); UMT Protection des abeilles dans l’environnement (UMT PrADE); Association pour le Developpement de l'Apiculture Provencale (ADAPI)-Institut de l'abeille (ITSAP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Terres Inovia-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE); SFBI
Source: JOBIM 2024 ; https://hal.inrae.fr/hal-04848078 ; JOBIM 2024, Jun 2024, Toulouse, France
Publisher Information: CCSD
Publication Year: 2024
Collection: Université Toulouse III - Paul Sabatier: HAL-UPS
Subject Terms: [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology; [SDV.BIBS]Life Sciences [q-bio]/Quantitative Methods [q-bio.QM]; [SDV.GEN.GA]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Animal genetics
Subject Geographic: Toulouse; France
Description: International audience ; Over the last decade, taking advantage of the small genome size of honey bees(225 Mb) and the fact that males (drones) are haploïd, our research team located atINRAE in Toulouse, France, has built up a large dataset of phased honey beegenomes. However, sample collection requires regular visits to the hives, which canbe an issue for large regional sampling.Therefore, our “Mallaurie'' project aims at testing a potential alternative by directshotgun sequencing of honey samples,. This approach could have several associated advantages : (i)non-lethal sampling, (ii) lower carbon footprints (iii) easy access to a larger diversitygiven the importance of the worldwide market and (iv) access to metagenomic data,such as microbiome, parasites, plants etc.
Document Type: conference object; still image
Language: English
Availability: https://hal.inrae.fr/hal-04848078
Accession Number: edsbas.F7D0CFD3
Database: BASE