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1
Tailored molecular modelling and machine learning solutions for small-molecule drug discovery

von Filella-Merce, I ; Vilalta-Mor, J ; Guallar, Victor

Schlagworte: Àrees temàtiques de la UPC::Informàtica::Arquitectura de computadors; High performance computing; machine learning; generative modelling networks; molecular modelling; active learning; Càlcul intensiu (Informàtica)
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2
Inhibiting Type VI Secretion System Activity with a Biomimetic Peptide Designed To Target the Baseplate Wedge Complex

von Y. Cherrak ; I. Filella-Merce ; V. Schmidt ; et al.

mBio, Vol 12, Iss 4 (2021)

Schlagworte: bacterial secretion system; type VI secretion system; T6SS; bioinformatic; biomimetic peptide; protein-protein interface; Microbiology; QR1-502
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3
Revisiting the molecular interactions between the tumor protein TCTP and the drugs sertraline/thioridazine

von Cherrak, Y. ; Filella-Merce, I. ; Schmidt, V. ; et al.

ISSN: 1860-7179.

Schlagworte: [SDV.SP.PHARMA]Life Sciences [q-bio]/Pharmaceutical sciences/Pharmacology; [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer
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4
Impaired semantic word learning in primary progressive aphasia.

von Olivé G ; Cardona G ; Porto MF ; et al.

Brain structure & function [Brain Struct Funct] 2026 Mar 26; Vol. 231 (3). Date of Electronic Publication: 2026 Mar 26.
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5
Optimizing drug design by merging generative AI with a physics-based active learning framework.

von Filella-Merce I ; Molina A ; Díaz L ; et al.

Communications chemistry [Commun Chem] 2025 Aug 08; Vol. 8 (1), pp. 238. Date of Electronic Publication: 2025 Aug 08.
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6
AlignScape, displaying sequence similarity using self-organizing maps.

von Filella-Merce I ; Mallet V ; Durand E ; et al.

Frontiers in bioinformatics [Front Bioinform] 2024 Jan 26; Vol. 4, pp. 1321508. Date of Electronic Publication: 2024 Jan 26 (Print Publication: 2024).
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7
Acinetobacter type VI secretion system comprises a non-canonical membrane complex.

von Kandolo O ; Cherrak Y ; Filella-Merce I ; et al.

PLoS pathogens [PLoS Pathog] 2023 Sep 28; Vol. 19 (9), pp. e1011687. Date of Electronic Publication: 2023 Sep 28 (Print Publication: 2023).
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8
Coevolution-Guided Mapping of the Type VI Secretion Membrane Complex-Baseplate Interface.

von Vanlioğlu E ; Santin YG ; Filella-Merce I ; et al.

Journal of molecular biology [J Mol Biol] 2023 Jan 30; Vol. 435 (2), pp. 167918. Date of Electronic Publication: 2022 Dec 09.
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9
Quantitative Structural Interpretation of Protein Crosslinks.

von Filella-Merce I ; Bardiaux B ; Nilges M ; et al.

Structure (London, England : 1993) [Structure] 2020 Jan 07; Vol. 28 (1), pp. 75-82.e4. Date of Electronic Publication: 2019 Nov 18.
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